Protein–RNA interactions for Protein: O75648

TRMU, Mitochondrial tRNA-specific 2-thiouridylase 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 421 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRMUO75648 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TRMUO75648 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TRMUO75648 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TRMUO75648 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TRMUO75648 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TRMUO75648 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TRMUO75648 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TRMUO75648 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TRMUO75648 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TRMUO75648 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TRMUO75648 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TRMUO75648 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TRMUO75648 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TRMUO75648 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TRMUO75648 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TRMUO75648 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TRMUO75648 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TRMUO75648 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TRMUO75648 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TRMUO75648 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TRMUO75648 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TRMUO75648 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TRMUO75648 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
TRMUO75648 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TRMUO75648 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TRMUO75648 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TRMUO75648 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TRMUO75648 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TRMUO75648 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TRMUO75648 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
TRMUO75648 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TRMUO75648 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
TRMUO75648 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TRMUO75648 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TRMUO75648 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TRMUO75648 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TRMUO75648 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TRMUO75648 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TRMUO75648 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TRMUO75648 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TRMUO75648 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TRMUO75648 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TRMUO75648 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TRMUO75648 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TRMUO75648 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TRMUO75648 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TRMUO75648 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
TRMUO75648 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
TRMUO75648 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TRMUO75648 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TRMUO75648 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TRMUO75648 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TRMUO75648 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TRMUO75648 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TRMUO75648 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TRMUO75648 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TRMUO75648 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TRMUO75648 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TRMUO75648 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TRMUO75648 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TRMUO75648 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TRMUO75648 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TRMUO75648 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TRMUO75648 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TRMUO75648 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TRMUO75648 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TRMUO75648 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
TRMUO75648 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TRMUO75648 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TRMUO75648 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TRMUO75648 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TRMUO75648 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TRMUO75648 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TRMUO75648 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
TRMUO75648 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
TRMUO75648 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
TRMUO75648 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
TRMUO75648 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
TRMUO75648 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TRMUO75648 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TRMUO75648 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TRMUO75648 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TRMUO75648 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TRMUO75648 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TRMUO75648 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TRMUO75648 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TRMUO75648 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TRMUO75648 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TRMUO75648 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TRMUO75648 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TRMUO75648 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TRMUO75648 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TRMUO75648 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TRMUO75648 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TRMUO75648 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TRMUO75648 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TRMUO75648 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TRMUO75648 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TRMUO75648 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TRMUO75648 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.9 ms