Protein–RNA interactions for Protein: O75449

KATNA1, Katanin p60 ATPase-containing subunit A1, humanhuman

Predictions only

Length 491 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KATNA1O75449 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
KATNA1O75449 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
KATNA1O75449 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
KATNA1O75449 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
KATNA1O75449 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
KATNA1O75449 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
KATNA1O75449 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
KATNA1O75449 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
KATNA1O75449 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
KATNA1O75449 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
KATNA1O75449 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
KATNA1O75449 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
KATNA1O75449 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
KATNA1O75449 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
KATNA1O75449 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
KATNA1O75449 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
KATNA1O75449 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
KATNA1O75449 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
KATNA1O75449 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
KATNA1O75449 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
KATNA1O75449 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
KATNA1O75449 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
KATNA1O75449 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
KATNA1O75449 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
KATNA1O75449 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
KATNA1O75449 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
KATNA1O75449 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
KATNA1O75449 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
KATNA1O75449 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
KATNA1O75449 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
KATNA1O75449 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
KATNA1O75449 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
KATNA1O75449 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
KATNA1O75449 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
KATNA1O75449 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
KATNA1O75449 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
KATNA1O75449 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
KATNA1O75449 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
KATNA1O75449 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
KATNA1O75449 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
KATNA1O75449 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
KATNA1O75449 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
KATNA1O75449 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
KATNA1O75449 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
KATNA1O75449 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
KATNA1O75449 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
KATNA1O75449 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
KATNA1O75449 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
KATNA1O75449 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
KATNA1O75449 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
KATNA1O75449 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
KATNA1O75449 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
KATNA1O75449 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
KATNA1O75449 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
KATNA1O75449 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
KATNA1O75449 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
KATNA1O75449 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
KATNA1O75449 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
KATNA1O75449 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
KATNA1O75449 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
KATNA1O75449 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC23■■□□□ 1.27
KATNA1O75449 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
KATNA1O75449 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
KATNA1O75449 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC23■■□□□ 1.27
KATNA1O75449 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
KATNA1O75449 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
KATNA1O75449 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
KATNA1O75449 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
KATNA1O75449 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
KATNA1O75449 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
KATNA1O75449 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
KATNA1O75449 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
KATNA1O75449 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
KATNA1O75449 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
KATNA1O75449 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
KATNA1O75449 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
KATNA1O75449 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
KATNA1O75449 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
KATNA1O75449 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
KATNA1O75449 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
KATNA1O75449 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
KATNA1O75449 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
KATNA1O75449 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
KATNA1O75449 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
KATNA1O75449 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
KATNA1O75449 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
KATNA1O75449 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
KATNA1O75449 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
KATNA1O75449 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
KATNA1O75449 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
KATNA1O75449 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
KATNA1O75449 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
KATNA1O75449 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
KATNA1O75449 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
KATNA1O75449 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
KATNA1O75449 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
KATNA1O75449 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
KATNA1O75449 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
KATNA1O75449 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
KATNA1O75449 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 129.5 ms