Protein–RNA interactions for Protein: O75192

PEX11A, Peroxisomal membrane protein 11A, humanhuman

Predictions only

Length 247 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEX11AO75192 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PEX11AO75192 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PEX11AO75192 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PEX11AO75192 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PEX11AO75192 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PEX11AO75192 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PEX11AO75192 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PEX11AO75192 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PEX11AO75192 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PEX11AO75192 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PEX11AO75192 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PEX11AO75192 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PEX11AO75192 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PEX11AO75192 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PEX11AO75192 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PEX11AO75192 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PEX11AO75192 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PEX11AO75192 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PEX11AO75192 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PEX11AO75192 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PEX11AO75192 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PEX11AO75192 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PEX11AO75192 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PEX11AO75192 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PEX11AO75192 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PEX11AO75192 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PEX11AO75192 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PEX11AO75192 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PEX11AO75192 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PEX11AO75192 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PEX11AO75192 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PEX11AO75192 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PEX11AO75192 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PEX11AO75192 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PEX11AO75192 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PEX11AO75192 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PEX11AO75192 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
PEX11AO75192 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
PEX11AO75192 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
PEX11AO75192 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PEX11AO75192 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PEX11AO75192 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
PEX11AO75192 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
PEX11AO75192 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PEX11AO75192 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
PEX11AO75192 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PEX11AO75192 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PEX11AO75192 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PEX11AO75192 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
PEX11AO75192 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PEX11AO75192 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PEX11AO75192 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PEX11AO75192 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PEX11AO75192 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
PEX11AO75192 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PEX11AO75192 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
PEX11AO75192 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PEX11AO75192 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
PEX11AO75192 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PEX11AO75192 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PEX11AO75192 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PEX11AO75192 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PEX11AO75192 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PEX11AO75192 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PEX11AO75192 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PEX11AO75192 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PEX11AO75192 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PEX11AO75192 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PEX11AO75192 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PEX11AO75192 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PEX11AO75192 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PEX11AO75192 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PEX11AO75192 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PEX11AO75192 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PEX11AO75192 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PEX11AO75192 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PEX11AO75192 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PEX11AO75192 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PEX11AO75192 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PEX11AO75192 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PEX11AO75192 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PEX11AO75192 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PEX11AO75192 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PEX11AO75192 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PEX11AO75192 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PEX11AO75192 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PEX11AO75192 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PEX11AO75192 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PEX11AO75192 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PEX11AO75192 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PEX11AO75192 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PEX11AO75192 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PEX11AO75192 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PEX11AO75192 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
PEX11AO75192 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PEX11AO75192 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PEX11AO75192 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PEX11AO75192 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PEX11AO75192 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PEX11AO75192 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms