Protein–RNA interactions for Protein: O75044

SRGAP2, SLIT-ROBO Rho GTPase-activating protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,071 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRGAP2O75044 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SRGAP2O75044 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
SRGAP2O75044 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SRGAP2O75044 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SRGAP2O75044 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SRGAP2O75044 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SRGAP2O75044 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SRGAP2O75044 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SRGAP2O75044 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SRGAP2O75044 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SRGAP2O75044 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SRGAP2O75044 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SRGAP2O75044 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SRGAP2O75044 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SRGAP2O75044 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
SRGAP2O75044 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SRGAP2O75044 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SRGAP2O75044 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SRGAP2O75044 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SRGAP2O75044 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SRGAP2O75044 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SRGAP2O75044 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SRGAP2O75044 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
SRGAP2O75044 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
SRGAP2O75044 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SRGAP2O75044 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SRGAP2O75044 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SRGAP2O75044 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
SRGAP2O75044 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
SRGAP2O75044 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SRGAP2O75044 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SRGAP2O75044 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
SRGAP2O75044 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SRGAP2O75044 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SRGAP2O75044 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
SRGAP2O75044 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SRGAP2O75044 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SRGAP2O75044 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SRGAP2O75044 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SRGAP2O75044 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SRGAP2O75044 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
SRGAP2O75044 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SRGAP2O75044 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SRGAP2O75044 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SRGAP2O75044 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SRGAP2O75044 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
SRGAP2O75044 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SRGAP2O75044 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SRGAP2O75044 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SRGAP2O75044 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SRGAP2O75044 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SRGAP2O75044 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SRGAP2O75044 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SRGAP2O75044 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SRGAP2O75044 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SRGAP2O75044 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SRGAP2O75044 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
SRGAP2O75044 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SRGAP2O75044 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SRGAP2O75044 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SRGAP2O75044 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SRGAP2O75044 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SRGAP2O75044 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SRGAP2O75044 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SRGAP2O75044 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SRGAP2O75044 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
SRGAP2O75044 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SRGAP2O75044 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SRGAP2O75044 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SRGAP2O75044 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SRGAP2O75044 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SRGAP2O75044 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SRGAP2O75044 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SRGAP2O75044 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SRGAP2O75044 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SRGAP2O75044 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SRGAP2O75044 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SRGAP2O75044 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SRGAP2O75044 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SRGAP2O75044 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SRGAP2O75044 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SRGAP2O75044 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SRGAP2O75044 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SRGAP2O75044 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SRGAP2O75044 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SRGAP2O75044 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SRGAP2O75044 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SRGAP2O75044 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SRGAP2O75044 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SRGAP2O75044 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
SRGAP2O75044 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SRGAP2O75044 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SRGAP2O75044 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SRGAP2O75044 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SRGAP2O75044 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SRGAP2O75044 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SRGAP2O75044 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SRGAP2O75044 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SRGAP2O75044 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SRGAP2O75044 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms