Protein–RNA interactions for Protein: O60602

TLR5, Toll-like receptor 5, humanhuman

Predictions only

Length 858 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TLR5O60602 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TLR5O60602 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TLR5O60602 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TLR5O60602 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TLR5O60602 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TLR5O60602 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TLR5O60602 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TLR5O60602 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TLR5O60602 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TLR5O60602 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TLR5O60602 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TLR5O60602 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TLR5O60602 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TLR5O60602 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TLR5O60602 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TLR5O60602 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TLR5O60602 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
TLR5O60602 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TLR5O60602 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TLR5O60602 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
TLR5O60602 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TLR5O60602 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TLR5O60602 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TLR5O60602 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TLR5O60602 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TLR5O60602 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TLR5O60602 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TLR5O60602 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TLR5O60602 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TLR5O60602 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TLR5O60602 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TLR5O60602 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TLR5O60602 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TLR5O60602 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TLR5O60602 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TLR5O60602 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TLR5O60602 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TLR5O60602 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TLR5O60602 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TLR5O60602 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TLR5O60602 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TLR5O60602 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TLR5O60602 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TLR5O60602 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TLR5O60602 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TLR5O60602 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
TLR5O60602 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TLR5O60602 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
TLR5O60602 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TLR5O60602 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
TLR5O60602 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TLR5O60602 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TLR5O60602 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TLR5O60602 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TLR5O60602 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TLR5O60602 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TLR5O60602 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TLR5O60602 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TLR5O60602 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TLR5O60602 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TLR5O60602 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TLR5O60602 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TLR5O60602 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TLR5O60602 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TLR5O60602 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
TLR5O60602 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TLR5O60602 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TLR5O60602 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TLR5O60602 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TLR5O60602 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TLR5O60602 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
TLR5O60602 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
TLR5O60602 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TLR5O60602 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TLR5O60602 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TLR5O60602 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TLR5O60602 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TLR5O60602 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TLR5O60602 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TLR5O60602 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TLR5O60602 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TLR5O60602 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
TLR5O60602 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
TLR5O60602 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
TLR5O60602 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
TLR5O60602 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
TLR5O60602 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TLR5O60602 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TLR5O60602 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TLR5O60602 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TLR5O60602 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TLR5O60602 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
TLR5O60602 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TLR5O60602 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
TLR5O60602 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TLR5O60602 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TLR5O60602 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TLR5O60602 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TLR5O60602 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TLR5O60602 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.1 ms