Protein–RNA interactions for Protein: O43896

KIF1C, Kinesin-like protein KIF1C, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,103 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIF1CO43896 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
KIF1CO43896 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
KIF1CO43896 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
KIF1CO43896 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
KIF1CO43896 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
KIF1CO43896 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
KIF1CO43896 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
KIF1CO43896 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
KIF1CO43896 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
KIF1CO43896 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
KIF1CO43896 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
KIF1CO43896 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
KIF1CO43896 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
KIF1CO43896 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
KIF1CO43896 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
KIF1CO43896 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
KIF1CO43896 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
KIF1CO43896 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
KIF1CO43896 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
KIF1CO43896 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
KIF1CO43896 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
KIF1CO43896 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
KIF1CO43896 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
KIF1CO43896 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
KIF1CO43896 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
KIF1CO43896 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
KIF1CO43896 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
KIF1CO43896 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
KIF1CO43896 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
KIF1CO43896 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
KIF1CO43896 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
KIF1CO43896 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
KIF1CO43896 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
KIF1CO43896 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
KIF1CO43896 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
KIF1CO43896 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
KIF1CO43896 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
KIF1CO43896 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
KIF1CO43896 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
KIF1CO43896 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
KIF1CO43896 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
KIF1CO43896 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
KIF1CO43896 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
KIF1CO43896 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
KIF1CO43896 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
KIF1CO43896 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
KIF1CO43896 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
KIF1CO43896 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
KIF1CO43896 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
KIF1CO43896 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
KIF1CO43896 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
KIF1CO43896 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
KIF1CO43896 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
KIF1CO43896 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
KIF1CO43896 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
KIF1CO43896 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
KIF1CO43896 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
KIF1CO43896 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
KIF1CO43896 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
KIF1CO43896 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
KIF1CO43896 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
KIF1CO43896 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
KIF1CO43896 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
KIF1CO43896 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
KIF1CO43896 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
KIF1CO43896 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
KIF1CO43896 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
KIF1CO43896 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
KIF1CO43896 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
KIF1CO43896 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
KIF1CO43896 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
KIF1CO43896 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
KIF1CO43896 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
KIF1CO43896 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
KIF1CO43896 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
KIF1CO43896 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
KIF1CO43896 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
KIF1CO43896 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
KIF1CO43896 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
KIF1CO43896 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
KIF1CO43896 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
KIF1CO43896 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
KIF1CO43896 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
KIF1CO43896 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
KIF1CO43896 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
KIF1CO43896 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
KIF1CO43896 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
KIF1CO43896 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
KIF1CO43896 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
KIF1CO43896 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
KIF1CO43896 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
KIF1CO43896 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
KIF1CO43896 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
KIF1CO43896 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
KIF1CO43896 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
KIF1CO43896 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
KIF1CO43896 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
KIF1CO43896 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
KIF1CO43896 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
KIF1CO43896 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.2 ms