Protein–RNA interactions for Protein: O43731

KDELR3, ER lumen protein-retaining receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDELR3O43731 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
KDELR3O43731 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
KDELR3O43731 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
KDELR3O43731 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
KDELR3O43731 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
KDELR3O43731 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
KDELR3O43731 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
KDELR3O43731 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
KDELR3O43731 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
KDELR3O43731 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
KDELR3O43731 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
KDELR3O43731 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
KDELR3O43731 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
KDELR3O43731 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
KDELR3O43731 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
KDELR3O43731 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
KDELR3O43731 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
KDELR3O43731 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
KDELR3O43731 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
KDELR3O43731 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
KDELR3O43731 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
KDELR3O43731 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
KDELR3O43731 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
KDELR3O43731 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
KDELR3O43731 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
KDELR3O43731 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
KDELR3O43731 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
KDELR3O43731 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
KDELR3O43731 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
KDELR3O43731 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
KDELR3O43731 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
KDELR3O43731 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
KDELR3O43731 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
KDELR3O43731 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
KDELR3O43731 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
KDELR3O43731 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
KDELR3O43731 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
KDELR3O43731 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
KDELR3O43731 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
KDELR3O43731 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
KDELR3O43731 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
KDELR3O43731 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
KDELR3O43731 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
KDELR3O43731 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
KDELR3O43731 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
KDELR3O43731 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
KDELR3O43731 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
KDELR3O43731 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
KDELR3O43731 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
KDELR3O43731 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
KDELR3O43731 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
KDELR3O43731 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
KDELR3O43731 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC23.9■■□□□ 1.42
KDELR3O43731 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
KDELR3O43731 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
KDELR3O43731 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
KDELR3O43731 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
KDELR3O43731 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
KDELR3O43731 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
KDELR3O43731 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
KDELR3O43731 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
KDELR3O43731 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
KDELR3O43731 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
KDELR3O43731 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
KDELR3O43731 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
KDELR3O43731 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
KDELR3O43731 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
KDELR3O43731 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
KDELR3O43731 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
KDELR3O43731 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
KDELR3O43731 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
KDELR3O43731 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
KDELR3O43731 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
KDELR3O43731 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
KDELR3O43731 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
KDELR3O43731 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
KDELR3O43731 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
KDELR3O43731 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
KDELR3O43731 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
KDELR3O43731 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
KDELR3O43731 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
KDELR3O43731 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
KDELR3O43731 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
KDELR3O43731 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
KDELR3O43731 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
KDELR3O43731 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
KDELR3O43731 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
KDELR3O43731 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
KDELR3O43731 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
KDELR3O43731 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
KDELR3O43731 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
KDELR3O43731 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
KDELR3O43731 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
KDELR3O43731 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
KDELR3O43731 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
KDELR3O43731 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
KDELR3O43731 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
KDELR3O43731 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
KDELR3O43731 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
KDELR3O43731 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms