Protein–RNA interactions for Protein: O43602

DCX, Neuronal migration protein doublecortin, humanhuman

Predictions only

Length 365 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCXO43602 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
DCXO43602 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
DCXO43602 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
DCXO43602 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
DCXO43602 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
DCXO43602 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
DCXO43602 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
DCXO43602 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
DCXO43602 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
DCXO43602 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
DCXO43602 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
DCXO43602 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
DCXO43602 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
DCXO43602 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
DCXO43602 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
DCXO43602 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
DCXO43602 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
DCXO43602 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
DCXO43602 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
DCXO43602 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
DCXO43602 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
DCXO43602 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
DCXO43602 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
DCXO43602 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
DCXO43602 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
DCXO43602 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
DCXO43602 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
DCXO43602 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
DCXO43602 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
DCXO43602 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
DCXO43602 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
DCXO43602 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
DCXO43602 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
DCXO43602 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
DCXO43602 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
DCXO43602 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
DCXO43602 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
DCXO43602 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
DCXO43602 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
DCXO43602 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
DCXO43602 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
DCXO43602 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC24.76■■□□□ 1.55
DCXO43602 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
DCXO43602 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
DCXO43602 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
DCXO43602 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
DCXO43602 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
DCXO43602 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
DCXO43602 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
DCXO43602 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
DCXO43602 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
DCXO43602 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
DCXO43602 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
DCXO43602 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
DCXO43602 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
DCXO43602 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
DCXO43602 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
DCXO43602 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
DCXO43602 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
DCXO43602 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
DCXO43602 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
DCXO43602 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
DCXO43602 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
DCXO43602 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
DCXO43602 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
DCXO43602 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
DCXO43602 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
DCXO43602 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
DCXO43602 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
DCXO43602 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
DCXO43602 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
DCXO43602 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
DCXO43602 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
DCXO43602 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
DCXO43602 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
DCXO43602 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
DCXO43602 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
DCXO43602 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
DCXO43602 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
DCXO43602 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
DCXO43602 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
DCXO43602 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
DCXO43602 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
DCXO43602 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
DCXO43602 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
DCXO43602 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
DCXO43602 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
DCXO43602 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
DCXO43602 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
DCXO43602 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
DCXO43602 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
DCXO43602 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
DCXO43602 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
DCXO43602 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
DCXO43602 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
DCXO43602 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
DCXO43602 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
DCXO43602 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
DCXO43602 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
DCXO43602 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms