Protein–RNA interactions for Protein: O43490

PROM1, Prominin-1, humanhuman

Predictions only

Length 865 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PROM1O43490 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PROM1O43490 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PROM1O43490 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PROM1O43490 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PROM1O43490 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PROM1O43490 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PROM1O43490 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PROM1O43490 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PROM1O43490 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PROM1O43490 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PROM1O43490 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PROM1O43490 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PROM1O43490 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PROM1O43490 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PROM1O43490 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
PROM1O43490 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
PROM1O43490 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PROM1O43490 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PROM1O43490 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PROM1O43490 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PROM1O43490 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PROM1O43490 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PROM1O43490 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
PROM1O43490 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PROM1O43490 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PROM1O43490 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PROM1O43490 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PROM1O43490 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PROM1O43490 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PROM1O43490 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PROM1O43490 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PROM1O43490 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PROM1O43490 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PROM1O43490 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PROM1O43490 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PROM1O43490 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
PROM1O43490 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PROM1O43490 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PROM1O43490 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PROM1O43490 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PROM1O43490 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PROM1O43490 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PROM1O43490 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PROM1O43490 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
PROM1O43490 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
PROM1O43490 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PROM1O43490 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PROM1O43490 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PROM1O43490 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PROM1O43490 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PROM1O43490 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PROM1O43490 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PROM1O43490 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PROM1O43490 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PROM1O43490 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PROM1O43490 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PROM1O43490 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PROM1O43490 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PROM1O43490 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PROM1O43490 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PROM1O43490 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PROM1O43490 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PROM1O43490 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PROM1O43490 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PROM1O43490 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PROM1O43490 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PROM1O43490 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PROM1O43490 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PROM1O43490 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PROM1O43490 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
PROM1O43490 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PROM1O43490 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PROM1O43490 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PROM1O43490 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PROM1O43490 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PROM1O43490 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PROM1O43490 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
PROM1O43490 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PROM1O43490 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PROM1O43490 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PROM1O43490 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PROM1O43490 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PROM1O43490 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PROM1O43490 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PROM1O43490 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PROM1O43490 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PROM1O43490 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PROM1O43490 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PROM1O43490 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PROM1O43490 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PROM1O43490 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PROM1O43490 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PROM1O43490 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PROM1O43490 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PROM1O43490 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PROM1O43490 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PROM1O43490 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PROM1O43490 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PROM1O43490 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PROM1O43490 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms