Protein–RNA interactions for Protein: O43424

GRID2, Glutamate receptor ionotropic, delta-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,007 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRID2O43424 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
GRID2O43424 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GRID2O43424 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
GRID2O43424 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GRID2O43424 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GRID2O43424 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
GRID2O43424 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GRID2O43424 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GRID2O43424 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GRID2O43424 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
GRID2O43424 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GRID2O43424 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GRID2O43424 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
GRID2O43424 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
GRID2O43424 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GRID2O43424 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
GRID2O43424 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
GRID2O43424 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GRID2O43424 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GRID2O43424 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GRID2O43424 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
GRID2O43424 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GRID2O43424 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
GRID2O43424 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GRID2O43424 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GRID2O43424 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
GRID2O43424 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
GRID2O43424 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
GRID2O43424 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
GRID2O43424 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
GRID2O43424 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
GRID2O43424 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
GRID2O43424 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
GRID2O43424 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
GRID2O43424 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
GRID2O43424 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
GRID2O43424 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GRID2O43424 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GRID2O43424 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GRID2O43424 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
GRID2O43424 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GRID2O43424 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GRID2O43424 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
GRID2O43424 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
GRID2O43424 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
GRID2O43424 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GRID2O43424 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GRID2O43424 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GRID2O43424 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GRID2O43424 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GRID2O43424 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GRID2O43424 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GRID2O43424 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GRID2O43424 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GRID2O43424 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GRID2O43424 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GRID2O43424 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GRID2O43424 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GRID2O43424 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GRID2O43424 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GRID2O43424 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GRID2O43424 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GRID2O43424 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GRID2O43424 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GRID2O43424 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GRID2O43424 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
GRID2O43424 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GRID2O43424 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GRID2O43424 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GRID2O43424 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GRID2O43424 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GRID2O43424 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GRID2O43424 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GRID2O43424 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GRID2O43424 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GRID2O43424 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GRID2O43424 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GRID2O43424 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GRID2O43424 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GRID2O43424 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GRID2O43424 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GRID2O43424 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GRID2O43424 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GRID2O43424 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
GRID2O43424 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
GRID2O43424 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
GRID2O43424 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
GRID2O43424 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
GRID2O43424 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
GRID2O43424 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
GRID2O43424 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
GRID2O43424 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
GRID2O43424 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
GRID2O43424 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
GRID2O43424 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
GRID2O43424 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
GRID2O43424 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GRID2O43424 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GRID2O43424 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GRID2O43424 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms