Protein–RNA interactions for Protein: O43364

HOXA2, Homeobox protein Hox-A2, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA2O43364 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
HOXA2O43364 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
HOXA2O43364 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
HOXA2O43364 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
HOXA2O43364 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
HOXA2O43364 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
HOXA2O43364 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
HOXA2O43364 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
HOXA2O43364 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
HOXA2O43364 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
HOXA2O43364 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
HOXA2O43364 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.66
HOXA2O43364 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
HOXA2O43364 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
HOXA2O43364 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
HOXA2O43364 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
HOXA2O43364 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
HOXA2O43364 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
HOXA2O43364 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
HOXA2O43364 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
HOXA2O43364 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
HOXA2O43364 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
HOXA2O43364 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
HOXA2O43364 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
HOXA2O43364 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
HOXA2O43364 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
HOXA2O43364 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
HOXA2O43364 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
HOXA2O43364 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
HOXA2O43364 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
HOXA2O43364 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
HOXA2O43364 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
HOXA2O43364 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
HOXA2O43364 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
HOXA2O43364 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
HOXA2O43364 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
HOXA2O43364 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
HOXA2O43364 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC25.36■■□□□ 1.65
HOXA2O43364 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC25.36■■□□□ 1.65
HOXA2O43364 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
HOXA2O43364 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
HOXA2O43364 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
HOXA2O43364 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
HOXA2O43364 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
HOXA2O43364 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
HOXA2O43364 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
HOXA2O43364 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
HOXA2O43364 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
HOXA2O43364 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
HOXA2O43364 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
HOXA2O43364 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
HOXA2O43364 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
HOXA2O43364 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
HOXA2O43364 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
HOXA2O43364 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
HOXA2O43364 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
HOXA2O43364 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
HOXA2O43364 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
HOXA2O43364 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
HOXA2O43364 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
HOXA2O43364 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
HOXA2O43364 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
HOXA2O43364 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.64
HOXA2O43364 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.64
HOXA2O43364 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
HOXA2O43364 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
HOXA2O43364 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
HOXA2O43364 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
HOXA2O43364 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
HOXA2O43364 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
HOXA2O43364 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
HOXA2O43364 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
HOXA2O43364 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
HOXA2O43364 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
HOXA2O43364 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
HOXA2O43364 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
HOXA2O43364 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
HOXA2O43364 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
HOXA2O43364 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
HOXA2O43364 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
HOXA2O43364 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
HOXA2O43364 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
HOXA2O43364 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
HOXA2O43364 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
HOXA2O43364 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
HOXA2O43364 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
HOXA2O43364 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
HOXA2O43364 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
HOXA2O43364 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
HOXA2O43364 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
HOXA2O43364 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
HOXA2O43364 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
HOXA2O43364 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC25.28■■□□□ 1.64
HOXA2O43364 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
HOXA2O43364 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
HOXA2O43364 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
HOXA2O43364 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
HOXA2O43364 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
HOXA2O43364 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
HOXA2O43364 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms