Protein–RNA interactions for Protein: O43242

PSMD3, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 534 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMD3O43242 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
PSMD3O43242 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
PSMD3O43242 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PSMD3O43242 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PSMD3O43242 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PSMD3O43242 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PSMD3O43242 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PSMD3O43242 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
PSMD3O43242 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PSMD3O43242 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PSMD3O43242 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PSMD3O43242 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PSMD3O43242 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PSMD3O43242 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PSMD3O43242 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PSMD3O43242 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PSMD3O43242 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
PSMD3O43242 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PSMD3O43242 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PSMD3O43242 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PSMD3O43242 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PSMD3O43242 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PSMD3O43242 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PSMD3O43242 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
PSMD3O43242 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PSMD3O43242 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PSMD3O43242 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PSMD3O43242 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PSMD3O43242 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PSMD3O43242 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PSMD3O43242 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PSMD3O43242 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PSMD3O43242 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PSMD3O43242 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PSMD3O43242 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PSMD3O43242 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PSMD3O43242 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PSMD3O43242 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PSMD3O43242 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PSMD3O43242 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PSMD3O43242 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PSMD3O43242 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PSMD3O43242 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PSMD3O43242 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PSMD3O43242 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PSMD3O43242 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PSMD3O43242 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PSMD3O43242 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PSMD3O43242 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PSMD3O43242 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PSMD3O43242 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PSMD3O43242 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PSMD3O43242 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PSMD3O43242 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
PSMD3O43242 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PSMD3O43242 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PSMD3O43242 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PSMD3O43242 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PSMD3O43242 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PSMD3O43242 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PSMD3O43242 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
PSMD3O43242 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PSMD3O43242 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PSMD3O43242 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PSMD3O43242 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PSMD3O43242 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PSMD3O43242 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PSMD3O43242 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PSMD3O43242 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PSMD3O43242 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PSMD3O43242 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PSMD3O43242 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PSMD3O43242 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PSMD3O43242 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PSMD3O43242 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
PSMD3O43242 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PSMD3O43242 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PSMD3O43242 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PSMD3O43242 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PSMD3O43242 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PSMD3O43242 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PSMD3O43242 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PSMD3O43242 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PSMD3O43242 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PSMD3O43242 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PSMD3O43242 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PSMD3O43242 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PSMD3O43242 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PSMD3O43242 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PSMD3O43242 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PSMD3O43242 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PSMD3O43242 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PSMD3O43242 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PSMD3O43242 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PSMD3O43242 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PSMD3O43242 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
PSMD3O43242 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PSMD3O43242 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
PSMD3O43242 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
PSMD3O43242 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10 ms