Protein–RNA interactions for Protein: O15522

NKX2-8, Homeobox protein Nkx-2.8, humanhuman

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Length 239 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKX2-8O15522 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NKX2-8O15522 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NKX2-8O15522 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NKX2-8O15522 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NKX2-8O15522 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NKX2-8O15522 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NKX2-8O15522 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NKX2-8O15522 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
NKX2-8O15522 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
NKX2-8O15522 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
NKX2-8O15522 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NKX2-8O15522 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
NKX2-8O15522 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
NKX2-8O15522 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
NKX2-8O15522 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
NKX2-8O15522 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
NKX2-8O15522 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
NKX2-8O15522 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
NKX2-8O15522 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
NKX2-8O15522 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
NKX2-8O15522 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
NKX2-8O15522 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
NKX2-8O15522 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
NKX2-8O15522 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
NKX2-8O15522 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
NKX2-8O15522 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
NKX2-8O15522 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
NKX2-8O15522 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
NKX2-8O15522 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NKX2-8O15522 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
NKX2-8O15522 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
NKX2-8O15522 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NKX2-8O15522 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NKX2-8O15522 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
NKX2-8O15522 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NKX2-8O15522 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NKX2-8O15522 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NKX2-8O15522 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NKX2-8O15522 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
NKX2-8O15522 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NKX2-8O15522 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NKX2-8O15522 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
NKX2-8O15522 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NKX2-8O15522 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
NKX2-8O15522 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
NKX2-8O15522 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NKX2-8O15522 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NKX2-8O15522 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NKX2-8O15522 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
NKX2-8O15522 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
NKX2-8O15522 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
NKX2-8O15522 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
NKX2-8O15522 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NKX2-8O15522 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
NKX2-8O15522 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NKX2-8O15522 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NKX2-8O15522 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
NKX2-8O15522 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
NKX2-8O15522 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
NKX2-8O15522 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NKX2-8O15522 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NKX2-8O15522 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
NKX2-8O15522 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
NKX2-8O15522 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
NKX2-8O15522 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
NKX2-8O15522 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
NKX2-8O15522 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NKX2-8O15522 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NKX2-8O15522 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
NKX2-8O15522 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NKX2-8O15522 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NKX2-8O15522 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
NKX2-8O15522 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
NKX2-8O15522 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
NKX2-8O15522 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NKX2-8O15522 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NKX2-8O15522 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NKX2-8O15522 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
NKX2-8O15522 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
NKX2-8O15522 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
NKX2-8O15522 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NKX2-8O15522 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC21.8■■□□□ 1.08
NKX2-8O15522 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
NKX2-8O15522 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
NKX2-8O15522 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NKX2-8O15522 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NKX2-8O15522 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NKX2-8O15522 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NKX2-8O15522 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
NKX2-8O15522 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NKX2-8O15522 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NKX2-8O15522 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NKX2-8O15522 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
NKX2-8O15522 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
NKX2-8O15522 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
NKX2-8O15522 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
NKX2-8O15522 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
NKX2-8O15522 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NKX2-8O15522 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
NKX2-8O15522 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
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