Protein–RNA interactions for Protein: O15446

CD3EAP, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA34, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 510 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD3EAPO15446 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CD3EAPO15446 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CD3EAPO15446 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CD3EAPO15446 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CD3EAPO15446 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CD3EAPO15446 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CD3EAPO15446 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CD3EAPO15446 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CD3EAPO15446 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CD3EAPO15446 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CD3EAPO15446 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CD3EAPO15446 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CD3EAPO15446 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CD3EAPO15446 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CD3EAPO15446 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CD3EAPO15446 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CD3EAPO15446 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CD3EAPO15446 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CD3EAPO15446 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CD3EAPO15446 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CD3EAPO15446 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CD3EAPO15446 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CD3EAPO15446 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CD3EAPO15446 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CD3EAPO15446 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
CD3EAPO15446 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CD3EAPO15446 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CD3EAPO15446 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CD3EAPO15446 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CD3EAPO15446 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CD3EAPO15446 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CD3EAPO15446 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
CD3EAPO15446 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CD3EAPO15446 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CD3EAPO15446 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CD3EAPO15446 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CD3EAPO15446 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CD3EAPO15446 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CD3EAPO15446 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CD3EAPO15446 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CD3EAPO15446 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CD3EAPO15446 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CD3EAPO15446 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CD3EAPO15446 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CD3EAPO15446 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CD3EAPO15446 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CD3EAPO15446 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CD3EAPO15446 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CD3EAPO15446 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CD3EAPO15446 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CD3EAPO15446 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
CD3EAPO15446 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CD3EAPO15446 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CD3EAPO15446 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CD3EAPO15446 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CD3EAPO15446 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CD3EAPO15446 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CD3EAPO15446 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CD3EAPO15446 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CD3EAPO15446 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CD3EAPO15446 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CD3EAPO15446 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CD3EAPO15446 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CD3EAPO15446 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CD3EAPO15446 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CD3EAPO15446 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CD3EAPO15446 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CD3EAPO15446 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CD3EAPO15446 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CD3EAPO15446 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CD3EAPO15446 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CD3EAPO15446 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CD3EAPO15446 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CD3EAPO15446 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CD3EAPO15446 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CD3EAPO15446 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CD3EAPO15446 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
CD3EAPO15446 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
CD3EAPO15446 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
CD3EAPO15446 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CD3EAPO15446 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CD3EAPO15446 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
CD3EAPO15446 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CD3EAPO15446 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CD3EAPO15446 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CD3EAPO15446 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CD3EAPO15446 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CD3EAPO15446 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CD3EAPO15446 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CD3EAPO15446 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CD3EAPO15446 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CD3EAPO15446 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CD3EAPO15446 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CD3EAPO15446 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CD3EAPO15446 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CD3EAPO15446 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CD3EAPO15446 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CD3EAPO15446 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CD3EAPO15446 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CD3EAPO15446 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms