Protein–RNA interactions for Protein: O15111

CHUK, Inhibitor of nuclear factor kappa-B kinase subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 745 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHUKO15111 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CHUKO15111 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CHUKO15111 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CHUKO15111 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CHUKO15111 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CHUKO15111 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CHUKO15111 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CHUKO15111 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CHUKO15111 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CHUKO15111 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CHUKO15111 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CHUKO15111 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CHUKO15111 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CHUKO15111 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CHUKO15111 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CHUKO15111 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CHUKO15111 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CHUKO15111 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CHUKO15111 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CHUKO15111 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CHUKO15111 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CHUKO15111 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CHUKO15111 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CHUKO15111 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CHUKO15111 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CHUKO15111 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CHUKO15111 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CHUKO15111 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CHUKO15111 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CHUKO15111 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CHUKO15111 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CHUKO15111 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CHUKO15111 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CHUKO15111 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CHUKO15111 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CHUKO15111 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
CHUKO15111 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CHUKO15111 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CHUKO15111 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CHUKO15111 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
CHUKO15111 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
CHUKO15111 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
CHUKO15111 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CHUKO15111 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CHUKO15111 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CHUKO15111 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CHUKO15111 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CHUKO15111 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CHUKO15111 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CHUKO15111 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CHUKO15111 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CHUKO15111 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CHUKO15111 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CHUKO15111 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CHUKO15111 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CHUKO15111 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
CHUKO15111 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
CHUKO15111 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CHUKO15111 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CHUKO15111 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CHUKO15111 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CHUKO15111 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CHUKO15111 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CHUKO15111 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CHUKO15111 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CHUKO15111 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CHUKO15111 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CHUKO15111 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CHUKO15111 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CHUKO15111 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CHUKO15111 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
CHUKO15111 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CHUKO15111 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CHUKO15111 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CHUKO15111 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CHUKO15111 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CHUKO15111 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CHUKO15111 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CHUKO15111 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CHUKO15111 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CHUKO15111 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CHUKO15111 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CHUKO15111 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CHUKO15111 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CHUKO15111 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CHUKO15111 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CHUKO15111 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CHUKO15111 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CHUKO15111 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CHUKO15111 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CHUKO15111 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CHUKO15111 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CHUKO15111 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CHUKO15111 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CHUKO15111 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CHUKO15111 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CHUKO15111 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CHUKO15111 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CHUKO15111 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CHUKO15111 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms