Protein–RNA interactions for Protein: O14910

LIN7A, Protein lin-7 homolog A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIN7AO14910 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
LIN7AO14910 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
LIN7AO14910 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
LIN7AO14910 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
LIN7AO14910 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
LIN7AO14910 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
LIN7AO14910 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
LIN7AO14910 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
LIN7AO14910 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
LIN7AO14910 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
LIN7AO14910 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
LIN7AO14910 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
LIN7AO14910 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
LIN7AO14910 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
LIN7AO14910 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
LIN7AO14910 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LIN7AO14910 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LIN7AO14910 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LIN7AO14910 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LIN7AO14910 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LIN7AO14910 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
LIN7AO14910 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
LIN7AO14910 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
LIN7AO14910 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
LIN7AO14910 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LIN7AO14910 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
LIN7AO14910 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
LIN7AO14910 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LIN7AO14910 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
LIN7AO14910 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
LIN7AO14910 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
LIN7AO14910 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
LIN7AO14910 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
LIN7AO14910 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
LIN7AO14910 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
LIN7AO14910 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
LIN7AO14910 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
LIN7AO14910 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
LIN7AO14910 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
LIN7AO14910 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
LIN7AO14910 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
LIN7AO14910 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
LIN7AO14910 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
LIN7AO14910 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
LIN7AO14910 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
LIN7AO14910 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
LIN7AO14910 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
LIN7AO14910 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
LIN7AO14910 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
LIN7AO14910 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LIN7AO14910 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LIN7AO14910 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
LIN7AO14910 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
LIN7AO14910 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
LIN7AO14910 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LIN7AO14910 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LIN7AO14910 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LIN7AO14910 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LIN7AO14910 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LIN7AO14910 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LIN7AO14910 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LIN7AO14910 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LIN7AO14910 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LIN7AO14910 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LIN7AO14910 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
LIN7AO14910 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
LIN7AO14910 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
LIN7AO14910 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LIN7AO14910 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LIN7AO14910 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
LIN7AO14910 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LIN7AO14910 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
LIN7AO14910 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
LIN7AO14910 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
LIN7AO14910 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LIN7AO14910 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LIN7AO14910 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LIN7AO14910 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
LIN7AO14910 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
LIN7AO14910 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LIN7AO14910 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LIN7AO14910 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
LIN7AO14910 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LIN7AO14910 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
LIN7AO14910 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LIN7AO14910 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
LIN7AO14910 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LIN7AO14910 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LIN7AO14910 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LIN7AO14910 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
LIN7AO14910 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LIN7AO14910 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
LIN7AO14910 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
LIN7AO14910 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
LIN7AO14910 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
LIN7AO14910 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
LIN7AO14910 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
LIN7AO14910 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
LIN7AO14910 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
LIN7AO14910 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 114.6 ms