Protein–RNA interactions for Protein: O14863

SLC30A4, Zinc transporter 4, humanhuman

Predictions only

Length 429 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC30A4O14863 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC30A4O14863 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC30A4O14863 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC30A4O14863 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC30A4O14863 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC30A4O14863 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC30A4O14863 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC30A4O14863 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC30A4O14863 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC30A4O14863 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC30A4O14863 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC30A4O14863 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC30A4O14863 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC30A4O14863 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC30A4O14863 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC30A4O14863 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC30A4O14863 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC30A4O14863 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC30A4O14863 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC30A4O14863 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC30A4O14863 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC30A4O14863 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC30A4O14863 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC30A4O14863 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC30A4O14863 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC30A4O14863 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC30A4O14863 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC30A4O14863 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC30A4O14863 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC30A4O14863 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC30A4O14863 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC30A4O14863 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC30A4O14863 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC30A4O14863 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC30A4O14863 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC30A4O14863 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC30A4O14863 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC30A4O14863 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC30A4O14863 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC30A4O14863 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC30A4O14863 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC30A4O14863 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC30A4O14863 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC30A4O14863 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC30A4O14863 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC30A4O14863 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC30A4O14863 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC30A4O14863 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC30A4O14863 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC30A4O14863 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC30A4O14863 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC30A4O14863 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC30A4O14863 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC30A4O14863 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC30A4O14863 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC30A4O14863 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC30A4O14863 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC30A4O14863 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC30A4O14863 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC30A4O14863 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC30A4O14863 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC30A4O14863 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC30A4O14863 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC30A4O14863 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC30A4O14863 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC30A4O14863 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC30A4O14863 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC30A4O14863 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC30A4O14863 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC30A4O14863 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC30A4O14863 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC30A4O14863 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC30A4O14863 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC30A4O14863 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC30A4O14863 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC30A4O14863 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC30A4O14863 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC30A4O14863 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC30A4O14863 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC30A4O14863 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC30A4O14863 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC30A4O14863 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC30A4O14863 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC30A4O14863 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC30A4O14863 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC30A4O14863 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC30A4O14863 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC30A4O14863 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC30A4O14863 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC30A4O14863 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC30A4O14863 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC30A4O14863 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC30A4O14863 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC30A4O14863 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC30A4O14863 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC30A4O14863 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SLC30A4O14863 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SLC30A4O14863 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SLC30A4O14863 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SLC30A4O14863 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms