Protein–RNA interactions for Protein: O14813

PHOX2A, Paired mesoderm homeobox protein 2A, humanhuman

Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHOX2AO14813 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PHOX2AO14813 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
PHOX2AO14813 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PHOX2AO14813 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PHOX2AO14813 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PHOX2AO14813 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PHOX2AO14813 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PHOX2AO14813 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PHOX2AO14813 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PHOX2AO14813 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PHOX2AO14813 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PHOX2AO14813 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PHOX2AO14813 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PHOX2AO14813 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PHOX2AO14813 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PHOX2AO14813 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PHOX2AO14813 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PHOX2AO14813 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PHOX2AO14813 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PHOX2AO14813 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PHOX2AO14813 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PHOX2AO14813 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PHOX2AO14813 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PHOX2AO14813 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PHOX2AO14813 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PHOX2AO14813 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PHOX2AO14813 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PHOX2AO14813 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
PHOX2AO14813 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PHOX2AO14813 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PHOX2AO14813 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PHOX2AO14813 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PHOX2AO14813 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PHOX2AO14813 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
PHOX2AO14813 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PHOX2AO14813 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PHOX2AO14813 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PHOX2AO14813 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PHOX2AO14813 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PHOX2AO14813 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PHOX2AO14813 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PHOX2AO14813 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PHOX2AO14813 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PHOX2AO14813 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PHOX2AO14813 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PHOX2AO14813 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PHOX2AO14813 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PHOX2AO14813 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PHOX2AO14813 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PHOX2AO14813 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PHOX2AO14813 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PHOX2AO14813 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PHOX2AO14813 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PHOX2AO14813 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PHOX2AO14813 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PHOX2AO14813 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PHOX2AO14813 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PHOX2AO14813 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PHOX2AO14813 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PHOX2AO14813 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PHOX2AO14813 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PHOX2AO14813 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PHOX2AO14813 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PHOX2AO14813 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PHOX2AO14813 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PHOX2AO14813 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PHOX2AO14813 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PHOX2AO14813 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PHOX2AO14813 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PHOX2AO14813 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PHOX2AO14813 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PHOX2AO14813 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PHOX2AO14813 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PHOX2AO14813 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PHOX2AO14813 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PHOX2AO14813 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PHOX2AO14813 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PHOX2AO14813 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
PHOX2AO14813 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PHOX2AO14813 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PHOX2AO14813 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PHOX2AO14813 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PHOX2AO14813 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PHOX2AO14813 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PHOX2AO14813 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PHOX2AO14813 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PHOX2AO14813 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PHOX2AO14813 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PHOX2AO14813 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PHOX2AO14813 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PHOX2AO14813 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PHOX2AO14813 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PHOX2AO14813 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PHOX2AO14813 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PHOX2AO14813 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PHOX2AO14813 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PHOX2AO14813 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PHOX2AO14813 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PHOX2AO14813 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PHOX2AO14813 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms