Protein–RNA interactions for Protein: O14593

RFXANK, DNA-binding protein RFXANK, humanhuman

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFXANKO14593 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
RFXANKO14593 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RFXANKO14593 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RFXANKO14593 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RFXANKO14593 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RFXANKO14593 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RFXANKO14593 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RFXANKO14593 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RFXANKO14593 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RFXANKO14593 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RFXANKO14593 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RFXANKO14593 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RFXANKO14593 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RFXANKO14593 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RFXANKO14593 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RFXANKO14593 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RFXANKO14593 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RFXANKO14593 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RFXANKO14593 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RFXANKO14593 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RFXANKO14593 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RFXANKO14593 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RFXANKO14593 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RFXANKO14593 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RFXANKO14593 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RFXANKO14593 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RFXANKO14593 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RFXANKO14593 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RFXANKO14593 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RFXANKO14593 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RFXANKO14593 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RFXANKO14593 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RFXANKO14593 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RFXANKO14593 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RFXANKO14593 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RFXANKO14593 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RFXANKO14593 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RFXANKO14593 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RFXANKO14593 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RFXANKO14593 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RFXANKO14593 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RFXANKO14593 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RFXANKO14593 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RFXANKO14593 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
RFXANKO14593 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RFXANKO14593 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RFXANKO14593 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RFXANKO14593 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RFXANKO14593 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RFXANKO14593 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RFXANKO14593 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RFXANKO14593 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
RFXANKO14593 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RFXANKO14593 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RFXANKO14593 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RFXANKO14593 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
RFXANKO14593 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RFXANKO14593 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RFXANKO14593 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RFXANKO14593 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RFXANKO14593 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RFXANKO14593 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RFXANKO14593 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RFXANKO14593 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RFXANKO14593 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RFXANKO14593 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RFXANKO14593 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
RFXANKO14593 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
RFXANKO14593 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RFXANKO14593 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RFXANKO14593 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
RFXANKO14593 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RFXANKO14593 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RFXANKO14593 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RFXANKO14593 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
RFXANKO14593 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RFXANKO14593 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RFXANKO14593 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RFXANKO14593 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RFXANKO14593 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RFXANKO14593 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RFXANKO14593 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
RFXANKO14593 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RFXANKO14593 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RFXANKO14593 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RFXANKO14593 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RFXANKO14593 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RFXANKO14593 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RFXANKO14593 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
RFXANKO14593 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RFXANKO14593 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RFXANKO14593 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RFXANKO14593 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RFXANKO14593 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RFXANKO14593 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RFXANKO14593 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RFXANKO14593 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RFXANKO14593 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RFXANKO14593 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RFXANKO14593 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms