Protein–RNA interactions for Protein: O14530

TXNDC9, Thioredoxin domain-containing protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 226 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TXNDC9O14530 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TXNDC9O14530 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TXNDC9O14530 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TXNDC9O14530 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
TXNDC9O14530 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TXNDC9O14530 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TXNDC9O14530 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TXNDC9O14530 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TXNDC9O14530 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TXNDC9O14530 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TXNDC9O14530 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
TXNDC9O14530 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TXNDC9O14530 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
TXNDC9O14530 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
TXNDC9O14530 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TXNDC9O14530 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TXNDC9O14530 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TXNDC9O14530 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TXNDC9O14530 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TXNDC9O14530 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TXNDC9O14530 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TXNDC9O14530 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
TXNDC9O14530 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TXNDC9O14530 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TXNDC9O14530 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TXNDC9O14530 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
TXNDC9O14530 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TXNDC9O14530 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TXNDC9O14530 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TXNDC9O14530 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TXNDC9O14530 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TXNDC9O14530 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TXNDC9O14530 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TXNDC9O14530 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TXNDC9O14530 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TXNDC9O14530 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TXNDC9O14530 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TXNDC9O14530 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TXNDC9O14530 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TXNDC9O14530 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TXNDC9O14530 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TXNDC9O14530 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TXNDC9O14530 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TXNDC9O14530 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TXNDC9O14530 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TXNDC9O14530 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TXNDC9O14530 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TXNDC9O14530 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TXNDC9O14530 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TXNDC9O14530 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TXNDC9O14530 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TXNDC9O14530 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TXNDC9O14530 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TXNDC9O14530 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TXNDC9O14530 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TXNDC9O14530 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TXNDC9O14530 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TXNDC9O14530 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TXNDC9O14530 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TXNDC9O14530 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TXNDC9O14530 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TXNDC9O14530 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
TXNDC9O14530 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TXNDC9O14530 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TXNDC9O14530 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TXNDC9O14530 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TXNDC9O14530 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TXNDC9O14530 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TXNDC9O14530 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
TXNDC9O14530 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
TXNDC9O14530 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TXNDC9O14530 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TXNDC9O14530 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
TXNDC9O14530 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TXNDC9O14530 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TXNDC9O14530 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TXNDC9O14530 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TXNDC9O14530 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
TXNDC9O14530 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TXNDC9O14530 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TXNDC9O14530 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TXNDC9O14530 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TXNDC9O14530 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TXNDC9O14530 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC23■■□□□ 1.27
TXNDC9O14530 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
TXNDC9O14530 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TXNDC9O14530 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TXNDC9O14530 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TXNDC9O14530 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TXNDC9O14530 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
TXNDC9O14530 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TXNDC9O14530 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TXNDC9O14530 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TXNDC9O14530 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TXNDC9O14530 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TXNDC9O14530 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TXNDC9O14530 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TXNDC9O14530 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TXNDC9O14530 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TXNDC9O14530 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.6 ms