Protein–RNA interactions for Protein: O14503

BHLHE40, Class E basic helix-loop-helix protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHLHE40O14503 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
BHLHE40O14503 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
BHLHE40O14503 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
BHLHE40O14503 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
BHLHE40O14503 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
BHLHE40O14503 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.98
BHLHE40O14503 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
BHLHE40O14503 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
BHLHE40O14503 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
BHLHE40O14503 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
BHLHE40O14503 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
BHLHE40O14503 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
BHLHE40O14503 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
BHLHE40O14503 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
BHLHE40O14503 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
BHLHE40O14503 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
BHLHE40O14503 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
BHLHE40O14503 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
BHLHE40O14503 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
BHLHE40O14503 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
BHLHE40O14503 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
BHLHE40O14503 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
BHLHE40O14503 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
BHLHE40O14503 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
BHLHE40O14503 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
BHLHE40O14503 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
BHLHE40O14503 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
BHLHE40O14503 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
BHLHE40O14503 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
BHLHE40O14503 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
BHLHE40O14503 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
BHLHE40O14503 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
BHLHE40O14503 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
BHLHE40O14503 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
BHLHE40O14503 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
BHLHE40O14503 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
BHLHE40O14503 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
BHLHE40O14503 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
BHLHE40O14503 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
BHLHE40O14503 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
BHLHE40O14503 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
BHLHE40O14503 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
BHLHE40O14503 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
BHLHE40O14503 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
BHLHE40O14503 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
BHLHE40O14503 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
BHLHE40O14503 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
BHLHE40O14503 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
BHLHE40O14503 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
BHLHE40O14503 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
BHLHE40O14503 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
BHLHE40O14503 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
BHLHE40O14503 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
BHLHE40O14503 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
BHLHE40O14503 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
BHLHE40O14503 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
BHLHE40O14503 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
BHLHE40O14503 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
BHLHE40O14503 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
BHLHE40O14503 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
BHLHE40O14503 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
BHLHE40O14503 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
BHLHE40O14503 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
BHLHE40O14503 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
BHLHE40O14503 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
BHLHE40O14503 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
BHLHE40O14503 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
BHLHE40O14503 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
BHLHE40O14503 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
BHLHE40O14503 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
BHLHE40O14503 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
BHLHE40O14503 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
BHLHE40O14503 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
BHLHE40O14503 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
BHLHE40O14503 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
BHLHE40O14503 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
BHLHE40O14503 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
BHLHE40O14503 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
BHLHE40O14503 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
BHLHE40O14503 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
BHLHE40O14503 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
BHLHE40O14503 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
BHLHE40O14503 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
BHLHE40O14503 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
BHLHE40O14503 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
BHLHE40O14503 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
BHLHE40O14503 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
BHLHE40O14503 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
BHLHE40O14503 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
BHLHE40O14503 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
BHLHE40O14503 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
BHLHE40O14503 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
BHLHE40O14503 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
BHLHE40O14503 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
BHLHE40O14503 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
BHLHE40O14503 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
BHLHE40O14503 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
BHLHE40O14503 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
BHLHE40O14503 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
BHLHE40O14503 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.7 ms