Protein–RNA interactions for Protein: O00743

PPP6C, Serine/threonine-protein phosphatase 6 catalytic subunit, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP6CO00743 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PPP6CO00743 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PPP6CO00743 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
PPP6CO00743 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PPP6CO00743 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PPP6CO00743 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PPP6CO00743 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PPP6CO00743 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PPP6CO00743 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PPP6CO00743 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
PPP6CO00743 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.24
PPP6CO00743 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PPP6CO00743 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PPP6CO00743 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PPP6CO00743 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PPP6CO00743 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PPP6CO00743 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PPP6CO00743 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
PPP6CO00743 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PPP6CO00743 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PPP6CO00743 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PPP6CO00743 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PPP6CO00743 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PPP6CO00743 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PPP6CO00743 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PPP6CO00743 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PPP6CO00743 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PPP6CO00743 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PPP6CO00743 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PPP6CO00743 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PPP6CO00743 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PPP6CO00743 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PPP6CO00743 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PPP6CO00743 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PPP6CO00743 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PPP6CO00743 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PPP6CO00743 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
PPP6CO00743 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PPP6CO00743 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PPP6CO00743 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PPP6CO00743 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PPP6CO00743 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PPP6CO00743 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PPP6CO00743 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PPP6CO00743 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
PPP6CO00743 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PPP6CO00743 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PPP6CO00743 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
PPP6CO00743 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PPP6CO00743 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PPP6CO00743 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PPP6CO00743 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PPP6CO00743 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PPP6CO00743 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PPP6CO00743 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PPP6CO00743 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PPP6CO00743 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PPP6CO00743 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PPP6CO00743 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PPP6CO00743 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PPP6CO00743 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PPP6CO00743 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PPP6CO00743 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PPP6CO00743 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PPP6CO00743 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PPP6CO00743 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PPP6CO00743 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PPP6CO00743 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PPP6CO00743 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PPP6CO00743 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PPP6CO00743 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PPP6CO00743 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PPP6CO00743 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PPP6CO00743 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PPP6CO00743 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PPP6CO00743 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PPP6CO00743 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
PPP6CO00743 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PPP6CO00743 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PPP6CO00743 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PPP6CO00743 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PPP6CO00743 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PPP6CO00743 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
PPP6CO00743 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PPP6CO00743 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PPP6CO00743 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PPP6CO00743 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PPP6CO00743 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PPP6CO00743 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PPP6CO00743 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PPP6CO00743 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
PPP6CO00743 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PPP6CO00743 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PPP6CO00743 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PPP6CO00743 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PPP6CO00743 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PPP6CO00743 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PPP6CO00743 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PPP6CO00743 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PPP6CO00743 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms