Protein–RNA interactions for Protein: O00635

TRIM38, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM38, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM38O00635 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TRIM38O00635 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TRIM38O00635 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TRIM38O00635 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TRIM38O00635 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TRIM38O00635 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
TRIM38O00635 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TRIM38O00635 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TRIM38O00635 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
TRIM38O00635 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TRIM38O00635 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRIM38O00635 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
TRIM38O00635 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRIM38O00635 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRIM38O00635 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRIM38O00635 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRIM38O00635 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRIM38O00635 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRIM38O00635 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRIM38O00635 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRIM38O00635 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
TRIM38O00635 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRIM38O00635 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TRIM38O00635 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TRIM38O00635 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TRIM38O00635 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TRIM38O00635 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TRIM38O00635 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TRIM38O00635 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TRIM38O00635 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TRIM38O00635 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TRIM38O00635 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRIM38O00635 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRIM38O00635 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRIM38O00635 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRIM38O00635 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
TRIM38O00635 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRIM38O00635 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRIM38O00635 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRIM38O00635 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TRIM38O00635 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TRIM38O00635 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TRIM38O00635 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TRIM38O00635 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
TRIM38O00635 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TRIM38O00635 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
TRIM38O00635 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
TRIM38O00635 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRIM38O00635 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRIM38O00635 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRIM38O00635 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
TRIM38O00635 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRIM38O00635 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRIM38O00635 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRIM38O00635 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRIM38O00635 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRIM38O00635 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
TRIM38O00635 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRIM38O00635 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRIM38O00635 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
TRIM38O00635 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRIM38O00635 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRIM38O00635 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRIM38O00635 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRIM38O00635 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRIM38O00635 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRIM38O00635 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRIM38O00635 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRIM38O00635 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRIM38O00635 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRIM38O00635 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRIM38O00635 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRIM38O00635 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRIM38O00635 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRIM38O00635 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRIM38O00635 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRIM38O00635 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRIM38O00635 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRIM38O00635 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRIM38O00635 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRIM38O00635 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRIM38O00635 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRIM38O00635 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRIM38O00635 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRIM38O00635 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRIM38O00635 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
TRIM38O00635 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRIM38O00635 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRIM38O00635 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRIM38O00635 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRIM38O00635 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRIM38O00635 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRIM38O00635 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRIM38O00635 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRIM38O00635 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
TRIM38O00635 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
TRIM38O00635 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
TRIM38O00635 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
TRIM38O00635 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
TRIM38O00635 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms