Protein–RNA interactions for Protein: O00268

TAF4, Transcription initiation factor TFIID subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,085 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF4O00268 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TAF4O00268 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
TAF4O00268 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TAF4O00268 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TAF4O00268 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TAF4O00268 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TAF4O00268 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TAF4O00268 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TAF4O00268 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TAF4O00268 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TAF4O00268 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TAF4O00268 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TAF4O00268 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TAF4O00268 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
TAF4O00268 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TAF4O00268 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TAF4O00268 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TAF4O00268 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TAF4O00268 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
TAF4O00268 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TAF4O00268 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TAF4O00268 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TAF4O00268 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TAF4O00268 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TAF4O00268 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TAF4O00268 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TAF4O00268 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TAF4O00268 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TAF4O00268 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TAF4O00268 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TAF4O00268 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
TAF4O00268 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TAF4O00268 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
TAF4O00268 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
TAF4O00268 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TAF4O00268 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TAF4O00268 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TAF4O00268 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TAF4O00268 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TAF4O00268 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TAF4O00268 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TAF4O00268 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TAF4O00268 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TAF4O00268 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TAF4O00268 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TAF4O00268 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TAF4O00268 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TAF4O00268 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TAF4O00268 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
TAF4O00268 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TAF4O00268 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TAF4O00268 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TAF4O00268 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TAF4O00268 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TAF4O00268 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TAF4O00268 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TAF4O00268 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TAF4O00268 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TAF4O00268 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TAF4O00268 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TAF4O00268 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TAF4O00268 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TAF4O00268 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TAF4O00268 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TAF4O00268 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TAF4O00268 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
TAF4O00268 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TAF4O00268 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TAF4O00268 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TAF4O00268 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TAF4O00268 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TAF4O00268 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TAF4O00268 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TAF4O00268 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TAF4O00268 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TAF4O00268 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TAF4O00268 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TAF4O00268 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TAF4O00268 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TAF4O00268 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TAF4O00268 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TAF4O00268 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TAF4O00268 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TAF4O00268 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TAF4O00268 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TAF4O00268 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TAF4O00268 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
TAF4O00268 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TAF4O00268 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TAF4O00268 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TAF4O00268 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TAF4O00268 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TAF4O00268 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TAF4O00268 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TAF4O00268 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TAF4O00268 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TAF4O00268 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TAF4O00268 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
TAF4O00268 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TAF4O00268 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12 ms