Protein–RNA interactions for Protein: O00253

AGRP, Agouti-related protein, humanhuman

Predictions only

Length 132 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGRPO00253 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
AGRPO00253 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
AGRPO00253 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
AGRPO00253 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
AGRPO00253 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
AGRPO00253 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
AGRPO00253 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
AGRPO00253 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
AGRPO00253 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
AGRPO00253 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
AGRPO00253 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
AGRPO00253 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
AGRPO00253 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
AGRPO00253 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
AGRPO00253 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
AGRPO00253 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
AGRPO00253 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
AGRPO00253 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
AGRPO00253 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
AGRPO00253 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
AGRPO00253 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
AGRPO00253 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
AGRPO00253 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
AGRPO00253 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
AGRPO00253 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
AGRPO00253 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
AGRPO00253 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
AGRPO00253 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
AGRPO00253 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
AGRPO00253 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
AGRPO00253 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
AGRPO00253 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
AGRPO00253 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
AGRPO00253 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
AGRPO00253 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
AGRPO00253 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
AGRPO00253 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
AGRPO00253 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
AGRPO00253 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
AGRPO00253 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
AGRPO00253 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
AGRPO00253 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
AGRPO00253 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
AGRPO00253 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
AGRPO00253 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
AGRPO00253 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
AGRPO00253 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
AGRPO00253 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
AGRPO00253 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
AGRPO00253 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
AGRPO00253 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
AGRPO00253 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
AGRPO00253 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
AGRPO00253 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
AGRPO00253 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
AGRPO00253 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
AGRPO00253 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
AGRPO00253 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
AGRPO00253 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
AGRPO00253 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
AGRPO00253 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
AGRPO00253 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
AGRPO00253 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
AGRPO00253 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
AGRPO00253 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
AGRPO00253 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
AGRPO00253 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
AGRPO00253 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
AGRPO00253 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
AGRPO00253 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
AGRPO00253 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
AGRPO00253 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
AGRPO00253 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
AGRPO00253 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
AGRPO00253 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
AGRPO00253 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
AGRPO00253 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
AGRPO00253 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
AGRPO00253 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
AGRPO00253 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
AGRPO00253 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
AGRPO00253 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
AGRPO00253 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
AGRPO00253 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
AGRPO00253 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
AGRPO00253 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
AGRPO00253 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
AGRPO00253 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
AGRPO00253 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
AGRPO00253 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
AGRPO00253 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
AGRPO00253 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
AGRPO00253 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
AGRPO00253 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
AGRPO00253 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
AGRPO00253 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
AGRPO00253 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
AGRPO00253 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
AGRPO00253 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
AGRPO00253 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.8 ms