Protein–RNA interactions for Protein: K7EJ46

SMIM22, Small integral membrane protein 22, humanhuman

Predictions only

Length 135 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM22K7EJ46 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
SMIM22K7EJ46 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
SMIM22K7EJ46 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
SMIM22K7EJ46 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
SMIM22K7EJ46 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
SMIM22K7EJ46 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
SMIM22K7EJ46 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
SMIM22K7EJ46 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
SMIM22K7EJ46 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
SMIM22K7EJ46 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
SMIM22K7EJ46 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
SMIM22K7EJ46 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
SMIM22K7EJ46 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
SMIM22K7EJ46 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
SMIM22K7EJ46 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
SMIM22K7EJ46 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
SMIM22K7EJ46 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
SMIM22K7EJ46 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
SMIM22K7EJ46 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
SMIM22K7EJ46 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
SMIM22K7EJ46 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
SMIM22K7EJ46 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
SMIM22K7EJ46 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
SMIM22K7EJ46 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
SMIM22K7EJ46 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
SMIM22K7EJ46 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
SMIM22K7EJ46 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SMIM22K7EJ46 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SMIM22K7EJ46 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SMIM22K7EJ46 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC27.87■■■□□ 2.05
SMIM22K7EJ46 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
SMIM22K7EJ46 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SMIM22K7EJ46 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
SMIM22K7EJ46 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SMIM22K7EJ46 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SMIM22K7EJ46 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
SMIM22K7EJ46 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SMIM22K7EJ46 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
SMIM22K7EJ46 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
SMIM22K7EJ46 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
SMIM22K7EJ46 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
SMIM22K7EJ46 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
SMIM22K7EJ46 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
SMIM22K7EJ46 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
SMIM22K7EJ46 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
SMIM22K7EJ46 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
SMIM22K7EJ46 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
SMIM22K7EJ46 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
SMIM22K7EJ46 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
SMIM22K7EJ46 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
SMIM22K7EJ46 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
SMIM22K7EJ46 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
SMIM22K7EJ46 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
SMIM22K7EJ46 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
SMIM22K7EJ46 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
SMIM22K7EJ46 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
SMIM22K7EJ46 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
SMIM22K7EJ46 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
SMIM22K7EJ46 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
SMIM22K7EJ46 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
SMIM22K7EJ46 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC27.83■■■□□ 2.05
SMIM22K7EJ46 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
SMIM22K7EJ46 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
SMIM22K7EJ46 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
SMIM22K7EJ46 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
SMIM22K7EJ46 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
SMIM22K7EJ46 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
SMIM22K7EJ46 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
SMIM22K7EJ46 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
SMIM22K7EJ46 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
SMIM22K7EJ46 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC27.81■■■□□ 2.04
SMIM22K7EJ46 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
SMIM22K7EJ46 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
SMIM22K7EJ46 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
SMIM22K7EJ46 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
SMIM22K7EJ46 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
SMIM22K7EJ46 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
SMIM22K7EJ46 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
SMIM22K7EJ46 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
SMIM22K7EJ46 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
SMIM22K7EJ46 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
SMIM22K7EJ46 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
SMIM22K7EJ46 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
SMIM22K7EJ46 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
SMIM22K7EJ46 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
SMIM22K7EJ46 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
SMIM22K7EJ46 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
SMIM22K7EJ46 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
SMIM22K7EJ46 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
SMIM22K7EJ46 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
SMIM22K7EJ46 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
SMIM22K7EJ46 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
SMIM22K7EJ46 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
SMIM22K7EJ46 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
SMIM22K7EJ46 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
SMIM22K7EJ46 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
SMIM22K7EJ46 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
SMIM22K7EJ46 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
SMIM22K7EJ46 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
SMIM22K7EJ46 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.1 ms