Protein–RNA interactions for Protein: J3KT08

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
J3KT08 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
J3KT08 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
J3KT08 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
J3KT08 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
J3KT08 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
J3KT08 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
J3KT08 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
J3KT08 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
J3KT08 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
J3KT08 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
J3KT08 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
J3KT08 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
J3KT08 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
J3KT08 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
J3KT08 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
J3KT08 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
J3KT08 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
J3KT08 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
J3KT08 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
J3KT08 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
J3KT08 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
J3KT08 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
J3KT08 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
J3KT08 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
J3KT08 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
J3KT08 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
J3KT08 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
J3KT08 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
J3KT08 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
J3KT08 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
J3KT08 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
J3KT08 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
J3KT08 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
J3KT08 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
J3KT08 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
J3KT08 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
J3KT08 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
J3KT08 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
J3KT08 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
J3KT08 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
J3KT08 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC14.46□□□□□ -0.09
J3KT08 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
J3KT08 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
J3KT08 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
J3KT08 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
J3KT08 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
J3KT08 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
J3KT08 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
J3KT08 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
J3KT08 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
J3KT08 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
J3KT08 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
J3KT08 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
J3KT08 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
J3KT08 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
J3KT08 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
J3KT08 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.1
J3KT08 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
J3KT08 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
J3KT08 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
J3KT08 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC14.45□□□□□ -0.1
J3KT08 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
J3KT08 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
J3KT08 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
J3KT08 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
J3KT08 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC14.44□□□□□ -0.1
J3KT08 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
J3KT08 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
J3KT08 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
J3KT08 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
J3KT08 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
J3KT08 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
J3KT08 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
J3KT08 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
J3KT08 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
J3KT08 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
J3KT08 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
J3KT08 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
J3KT08 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
J3KT08 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
J3KT08 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
J3KT08 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
J3KT08 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
J3KT08 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
J3KT08 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
J3KT08 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
J3KT08 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
J3KT08 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
J3KT08 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.43□□□□□ -0.1
J3KT08 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
J3KT08 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
J3KT08 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC14.42□□□□□ -0.1
J3KT08 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
J3KT08 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
J3KT08 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
J3KT08 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
J3KT08 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC14.42□□□□□ -0.1
J3KT08 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.42□□□□□ -0.1
J3KT08 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
J3KT08 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.9 ms