Protein–RNA interactions for Protein: F8WFD2

NPIPA3, Nuclear pore complex-interacting protein family member A3, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPIPA3F8WFD2 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
NPIPA3F8WFD2 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NPIPA3F8WFD2 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NPIPA3F8WFD2 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NPIPA3F8WFD2 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NPIPA3F8WFD2 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NPIPA3F8WFD2 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NPIPA3F8WFD2 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NPIPA3F8WFD2 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NPIPA3F8WFD2 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NPIPA3F8WFD2 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NPIPA3F8WFD2 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NPIPA3F8WFD2 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NPIPA3F8WFD2 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NPIPA3F8WFD2 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NPIPA3F8WFD2 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NPIPA3F8WFD2 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NPIPA3F8WFD2 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NPIPA3F8WFD2 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NPIPA3F8WFD2 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NPIPA3F8WFD2 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NPIPA3F8WFD2 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NPIPA3F8WFD2 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NPIPA3F8WFD2 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NPIPA3F8WFD2 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NPIPA3F8WFD2 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NPIPA3F8WFD2 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NPIPA3F8WFD2 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NPIPA3F8WFD2 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NPIPA3F8WFD2 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NPIPA3F8WFD2 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NPIPA3F8WFD2 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
NPIPA3F8WFD2 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
NPIPA3F8WFD2 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
NPIPA3F8WFD2 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
NPIPA3F8WFD2 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NPIPA3F8WFD2 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
NPIPA3F8WFD2 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NPIPA3F8WFD2 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NPIPA3F8WFD2 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NPIPA3F8WFD2 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
NPIPA3F8WFD2 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NPIPA3F8WFD2 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NPIPA3F8WFD2 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NPIPA3F8WFD2 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC21.31■■□□□ 1
NPIPA3F8WFD2 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
NPIPA3F8WFD2 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NPIPA3F8WFD2 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
NPIPA3F8WFD2 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NPIPA3F8WFD2 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NPIPA3F8WFD2 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NPIPA3F8WFD2 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
NPIPA3F8WFD2 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
NPIPA3F8WFD2 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC21.3■■□□□ 1
NPIPA3F8WFD2 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC21.3■■□□□ 1
NPIPA3F8WFD2 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
NPIPA3F8WFD2 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
NPIPA3F8WFD2 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NPIPA3F8WFD2 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
NPIPA3F8WFD2 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NPIPA3F8WFD2 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NPIPA3F8WFD2 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NPIPA3F8WFD2 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
NPIPA3F8WFD2 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NPIPA3F8WFD2 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NPIPA3F8WFD2 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NPIPA3F8WFD2 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC21.29■■□□□ 1
NPIPA3F8WFD2 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NPIPA3F8WFD2 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NPIPA3F8WFD2 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC21.29■■□□□ 1
NPIPA3F8WFD2 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC21.29■■□□□ 1
NPIPA3F8WFD2 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
NPIPA3F8WFD2 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
NPIPA3F8WFD2 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NPIPA3F8WFD2 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
NPIPA3F8WFD2 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NPIPA3F8WFD2 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC21.28■■□□□ 1
NPIPA3F8WFD2 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NPIPA3F8WFD2 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
NPIPA3F8WFD2 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NPIPA3F8WFD2 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NPIPA3F8WFD2 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NPIPA3F8WFD2 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
NPIPA3F8WFD2 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NPIPA3F8WFD2 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NPIPA3F8WFD2 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC21.27■■□□□ 1
NPIPA3F8WFD2 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
NPIPA3F8WFD2 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NPIPA3F8WFD2 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
NPIPA3F8WFD2 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NPIPA3F8WFD2 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NPIPA3F8WFD2 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
NPIPA3F8WFD2 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
NPIPA3F8WFD2 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
NPIPA3F8WFD2 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NPIPA3F8WFD2 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
NPIPA3F8WFD2 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NPIPA3F8WFD2 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
NPIPA3F8WFD2 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
NPIPA3F8WFD2 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms