Protein–RNA interactions for Protein: F8VP50

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
F8VP50 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
F8VP50 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
F8VP50 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
F8VP50 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
F8VP50 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
F8VP50 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
F8VP50 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
F8VP50 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
F8VP50 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
F8VP50 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
F8VP50 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
F8VP50 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
F8VP50 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
F8VP50 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
F8VP50 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
F8VP50 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
F8VP50 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
F8VP50 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
F8VP50 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
F8VP50 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
F8VP50 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
F8VP50 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
F8VP50 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
F8VP50 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
F8VP50 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
F8VP50 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
F8VP50 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
F8VP50 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
F8VP50 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
F8VP50 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
F8VP50 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
F8VP50 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
F8VP50 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
F8VP50 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
F8VP50 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
F8VP50 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
F8VP50 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
F8VP50 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
F8VP50 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
F8VP50 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
F8VP50 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
F8VP50 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
F8VP50 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
F8VP50 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
F8VP50 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
F8VP50 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
F8VP50 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
F8VP50 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
F8VP50 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
F8VP50 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
F8VP50 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
F8VP50 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
F8VP50 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
F8VP50 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
F8VP50 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
F8VP50 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
F8VP50 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
F8VP50 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
F8VP50 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
F8VP50 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
F8VP50 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
F8VP50 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
F8VP50 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
F8VP50 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
F8VP50 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
F8VP50 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
F8VP50 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
F8VP50 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
F8VP50 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
F8VP50 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
F8VP50 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
F8VP50 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
F8VP50 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
F8VP50 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
F8VP50 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
F8VP50 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
F8VP50 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
F8VP50 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
F8VP50 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
F8VP50 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
F8VP50 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
F8VP50 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
F8VP50 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
F8VP50 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
F8VP50 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
F8VP50 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
F8VP50 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
F8VP50 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
F8VP50 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
F8VP50 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
F8VP50 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
F8VP50 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
F8VP50 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
F8VP50 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
F8VP50 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
F8VP50 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
F8VP50 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
F8VP50 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
F8VP50 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
F8VP50 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms