Protein–RNA interactions for Protein: E9PIF3

NPIPA2, Nuclear pore complex-interacting protein family member A2, humanhuman

Predictions only

Length 369 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPIPA2E9PIF3 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
NPIPA2E9PIF3 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NPIPA2E9PIF3 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NPIPA2E9PIF3 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NPIPA2E9PIF3 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NPIPA2E9PIF3 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NPIPA2E9PIF3 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NPIPA2E9PIF3 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NPIPA2E9PIF3 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NPIPA2E9PIF3 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NPIPA2E9PIF3 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NPIPA2E9PIF3 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NPIPA2E9PIF3 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NPIPA2E9PIF3 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NPIPA2E9PIF3 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NPIPA2E9PIF3 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NPIPA2E9PIF3 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NPIPA2E9PIF3 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NPIPA2E9PIF3 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NPIPA2E9PIF3 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NPIPA2E9PIF3 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NPIPA2E9PIF3 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NPIPA2E9PIF3 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NPIPA2E9PIF3 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NPIPA2E9PIF3 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NPIPA2E9PIF3 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NPIPA2E9PIF3 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NPIPA2E9PIF3 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NPIPA2E9PIF3 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NPIPA2E9PIF3 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NPIPA2E9PIF3 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NPIPA2E9PIF3 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
NPIPA2E9PIF3 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
NPIPA2E9PIF3 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
NPIPA2E9PIF3 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
NPIPA2E9PIF3 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NPIPA2E9PIF3 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
NPIPA2E9PIF3 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NPIPA2E9PIF3 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NPIPA2E9PIF3 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NPIPA2E9PIF3 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
NPIPA2E9PIF3 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NPIPA2E9PIF3 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NPIPA2E9PIF3 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NPIPA2E9PIF3 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC21.31■■□□□ 1
NPIPA2E9PIF3 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
NPIPA2E9PIF3 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NPIPA2E9PIF3 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
NPIPA2E9PIF3 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NPIPA2E9PIF3 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NPIPA2E9PIF3 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NPIPA2E9PIF3 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
NPIPA2E9PIF3 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
NPIPA2E9PIF3 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC21.3■■□□□ 1
NPIPA2E9PIF3 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC21.3■■□□□ 1
NPIPA2E9PIF3 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
NPIPA2E9PIF3 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
NPIPA2E9PIF3 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NPIPA2E9PIF3 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
NPIPA2E9PIF3 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NPIPA2E9PIF3 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NPIPA2E9PIF3 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NPIPA2E9PIF3 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
NPIPA2E9PIF3 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NPIPA2E9PIF3 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NPIPA2E9PIF3 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NPIPA2E9PIF3 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC21.29■■□□□ 1
NPIPA2E9PIF3 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NPIPA2E9PIF3 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NPIPA2E9PIF3 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC21.29■■□□□ 1
NPIPA2E9PIF3 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC21.29■■□□□ 1
NPIPA2E9PIF3 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
NPIPA2E9PIF3 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
NPIPA2E9PIF3 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NPIPA2E9PIF3 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
NPIPA2E9PIF3 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NPIPA2E9PIF3 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC21.28■■□□□ 1
NPIPA2E9PIF3 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NPIPA2E9PIF3 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
NPIPA2E9PIF3 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NPIPA2E9PIF3 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NPIPA2E9PIF3 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NPIPA2E9PIF3 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
NPIPA2E9PIF3 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NPIPA2E9PIF3 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NPIPA2E9PIF3 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC21.27■■□□□ 1
NPIPA2E9PIF3 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
NPIPA2E9PIF3 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NPIPA2E9PIF3 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
NPIPA2E9PIF3 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NPIPA2E9PIF3 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NPIPA2E9PIF3 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
NPIPA2E9PIF3 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
NPIPA2E9PIF3 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
NPIPA2E9PIF3 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NPIPA2E9PIF3 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
NPIPA2E9PIF3 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NPIPA2E9PIF3 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
NPIPA2E9PIF3 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
NPIPA2E9PIF3 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms