Protein–RNA interactions for Protein: E9PGA6

C1QTNF3-AMACR, C1QTNF3-AMACR readthrough (NMD candidate), humanhuman

Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC23.57■■□□□ 1.36
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.4 ms