Protein–RNA interactions for Protein: C9J3I9

C5orf58, Putative uncharacterized protein C5orf58, humanhuman

Predictions only

Length 102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C5orf58C9J3I9 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
C5orf58C9J3I9 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
C5orf58C9J3I9 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.11
C5orf58C9J3I9 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.11
C5orf58C9J3I9 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.11
C5orf58C9J3I9 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
C5orf58C9J3I9 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
C5orf58C9J3I9 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
C5orf58C9J3I9 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
C5orf58C9J3I9 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
C5orf58C9J3I9 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
C5orf58C9J3I9 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
C5orf58C9J3I9 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
C5orf58C9J3I9 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
C5orf58C9J3I9 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
C5orf58C9J3I9 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
C5orf58C9J3I9 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
C5orf58C9J3I9 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
C5orf58C9J3I9 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
C5orf58C9J3I9 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
C5orf58C9J3I9 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
C5orf58C9J3I9 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
C5orf58C9J3I9 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
C5orf58C9J3I9 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
C5orf58C9J3I9 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
C5orf58C9J3I9 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
C5orf58C9J3I9 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
C5orf58C9J3I9 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
C5orf58C9J3I9 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
C5orf58C9J3I9 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
C5orf58C9J3I9 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
C5orf58C9J3I9 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
C5orf58C9J3I9 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
C5orf58C9J3I9 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
C5orf58C9J3I9 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
C5orf58C9J3I9 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
C5orf58C9J3I9 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
C5orf58C9J3I9 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
C5orf58C9J3I9 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
C5orf58C9J3I9 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
C5orf58C9J3I9 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
C5orf58C9J3I9 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
C5orf58C9J3I9 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
C5orf58C9J3I9 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
C5orf58C9J3I9 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
C5orf58C9J3I9 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
C5orf58C9J3I9 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
C5orf58C9J3I9 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
C5orf58C9J3I9 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
C5orf58C9J3I9 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
C5orf58C9J3I9 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
C5orf58C9J3I9 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
C5orf58C9J3I9 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
C5orf58C9J3I9 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
C5orf58C9J3I9 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
C5orf58C9J3I9 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
C5orf58C9J3I9 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
C5orf58C9J3I9 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
C5orf58C9J3I9 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
C5orf58C9J3I9 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
C5orf58C9J3I9 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
C5orf58C9J3I9 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
C5orf58C9J3I9 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
C5orf58C9J3I9 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
C5orf58C9J3I9 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
C5orf58C9J3I9 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
C5orf58C9J3I9 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
C5orf58C9J3I9 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
C5orf58C9J3I9 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
C5orf58C9J3I9 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
C5orf58C9J3I9 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
C5orf58C9J3I9 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
C5orf58C9J3I9 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
C5orf58C9J3I9 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
C5orf58C9J3I9 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
C5orf58C9J3I9 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
C5orf58C9J3I9 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
C5orf58C9J3I9 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
C5orf58C9J3I9 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
C5orf58C9J3I9 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
C5orf58C9J3I9 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
C5orf58C9J3I9 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
C5orf58C9J3I9 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
C5orf58C9J3I9 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
C5orf58C9J3I9 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
C5orf58C9J3I9 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
C5orf58C9J3I9 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
C5orf58C9J3I9 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
C5orf58C9J3I9 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
C5orf58C9J3I9 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
C5orf58C9J3I9 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
C5orf58C9J3I9 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
C5orf58C9J3I9 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
C5orf58C9J3I9 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
C5orf58C9J3I9 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
C5orf58C9J3I9 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
C5orf58C9J3I9 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
C5orf58C9J3I9 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
C5orf58C9J3I9 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
C5orf58C9J3I9 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms