Protein–RNA interactions for Protein: B6SEH9

ERVV-2, Endogenous retrovirus group V member 2 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 535 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVV-2B6SEH9 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC30.68■■■□□ 2.5
ERVV-2B6SEH9 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC30.68■■■□□ 2.5
ERVV-2B6SEH9 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
ERVV-2B6SEH9 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.68■■■□□ 2.5
ERVV-2B6SEH9 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
ERVV-2B6SEH9 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
ERVV-2B6SEH9 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC30.66■■■□□ 2.5
ERVV-2B6SEH9 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC30.66■■■□□ 2.5
ERVV-2B6SEH9 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
ERVV-2B6SEH9 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC30.66■■■□□ 2.5
ERVV-2B6SEH9 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC30.66■■■□□ 2.5
ERVV-2B6SEH9 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
ERVV-2B6SEH9 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC30.65■■■□□ 2.5
ERVV-2B6SEH9 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC30.65■■■□□ 2.5
ERVV-2B6SEH9 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC30.65■■■□□ 2.5
ERVV-2B6SEH9 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
ERVV-2B6SEH9 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC30.64■■■□□ 2.5
ERVV-2B6SEH9 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
ERVV-2B6SEH9 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC30.64■■■□□ 2.5
ERVV-2B6SEH9 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC30.64■■■□□ 2.5
ERVV-2B6SEH9 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC30.64■■■□□ 2.49
ERVV-2B6SEH9 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC30.63■■■□□ 2.49
ERVV-2B6SEH9 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
ERVV-2B6SEH9 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC30.63■■■□□ 2.49
ERVV-2B6SEH9 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC30.63■■■□□ 2.49
ERVV-2B6SEH9 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC30.63■■■□□ 2.49
ERVV-2B6SEH9 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC30.62■■■□□ 2.49
ERVV-2B6SEH9 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
ERVV-2B6SEH9 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
ERVV-2B6SEH9 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.62■■■□□ 2.49
ERVV-2B6SEH9 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC30.62■■■□□ 2.49
ERVV-2B6SEH9 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC30.62■■■□□ 2.49
ERVV-2B6SEH9 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC30.62■■■□□ 2.49
ERVV-2B6SEH9 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC30.62■■■□□ 2.49
ERVV-2B6SEH9 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
ERVV-2B6SEH9 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC30.62■■■□□ 2.49
ERVV-2B6SEH9 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
ERVV-2B6SEH9 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
ERVV-2B6SEH9 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC30.61■■■□□ 2.49
ERVV-2B6SEH9 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
ERVV-2B6SEH9 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
ERVV-2B6SEH9 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
ERVV-2B6SEH9 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
ERVV-2B6SEH9 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.6■■■□□ 2.49
ERVV-2B6SEH9 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC30.6■■■□□ 2.49
ERVV-2B6SEH9 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.6■■■□□ 2.49
ERVV-2B6SEH9 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC30.6■■■□□ 2.49
ERVV-2B6SEH9 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
ERVV-2B6SEH9 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
ERVV-2B6SEH9 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
ERVV-2B6SEH9 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
ERVV-2B6SEH9 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
ERVV-2B6SEH9 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
ERVV-2B6SEH9 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
ERVV-2B6SEH9 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC30.58■■■□□ 2.49
ERVV-2B6SEH9 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.58■■■□□ 2.49
ERVV-2B6SEH9 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC30.58■■■□□ 2.49
ERVV-2B6SEH9 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC30.57■■■□□ 2.48
ERVV-2B6SEH9 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
ERVV-2B6SEH9 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC30.57■■■□□ 2.48
ERVV-2B6SEH9 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
ERVV-2B6SEH9 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
ERVV-2B6SEH9 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
ERVV-2B6SEH9 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
ERVV-2B6SEH9 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC30.56■■■□□ 2.48
ERVV-2B6SEH9 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
ERVV-2B6SEH9 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC30.56■■■□□ 2.48
ERVV-2B6SEH9 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC30.55■■■□□ 2.48
ERVV-2B6SEH9 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC30.55■■■□□ 2.48
ERVV-2B6SEH9 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
ERVV-2B6SEH9 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
ERVV-2B6SEH9 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC30.54■■■□□ 2.48
ERVV-2B6SEH9 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
ERVV-2B6SEH9 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
ERVV-2B6SEH9 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC30.53■■■□□ 2.48
ERVV-2B6SEH9 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
ERVV-2B6SEH9 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
ERVV-2B6SEH9 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC30.52■■■□□ 2.48
ERVV-2B6SEH9 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.48
ERVV-2B6SEH9 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.48
ERVV-2B6SEH9 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC30.51■■■□□ 2.47
ERVV-2B6SEH9 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC30.51■■■□□ 2.47
ERVV-2B6SEH9 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC30.51■■■□□ 2.47
ERVV-2B6SEH9 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC30.51■■■□□ 2.47
ERVV-2B6SEH9 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
ERVV-2B6SEH9 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
ERVV-2B6SEH9 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
ERVV-2B6SEH9 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
ERVV-2B6SEH9 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC30.5■■■□□ 2.47
ERVV-2B6SEH9 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
ERVV-2B6SEH9 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
ERVV-2B6SEH9 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC30.5■■■□□ 2.47
ERVV-2B6SEH9 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC30.49■■■□□ 2.47
ERVV-2B6SEH9 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
ERVV-2B6SEH9 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.49■■■□□ 2.47
ERVV-2B6SEH9 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.49■■■□□ 2.47
ERVV-2B6SEH9 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
ERVV-2B6SEH9 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC30.49■■■□□ 2.47
ERVV-2B6SEH9 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC30.49■■■□□ 2.47
ERVV-2B6SEH9 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 193 ms