Protein–RNA interactions for Protein: B6SEH8

ERVV-1, Endogenous retrovirus group V member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVV-1B6SEH8 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
ERVV-1B6SEH8 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
ERVV-1B6SEH8 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
ERVV-1B6SEH8 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
ERVV-1B6SEH8 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC29.79■■■□□ 2.36
ERVV-1B6SEH8 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
ERVV-1B6SEH8 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC29.79■■■□□ 2.36
ERVV-1B6SEH8 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC29.79■■■□□ 2.36
ERVV-1B6SEH8 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
ERVV-1B6SEH8 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
ERVV-1B6SEH8 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC29.78■■■□□ 2.36
ERVV-1B6SEH8 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
ERVV-1B6SEH8 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC29.78■■■□□ 2.36
ERVV-1B6SEH8 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
ERVV-1B6SEH8 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
ERVV-1B6SEH8 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
ERVV-1B6SEH8 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC29.78■■■□□ 2.36
ERVV-1B6SEH8 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
ERVV-1B6SEH8 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
ERVV-1B6SEH8 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
ERVV-1B6SEH8 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
ERVV-1B6SEH8 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
ERVV-1B6SEH8 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
ERVV-1B6SEH8 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
ERVV-1B6SEH8 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.36
ERVV-1B6SEH8 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.36
ERVV-1B6SEH8 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.35
ERVV-1B6SEH8 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.35
ERVV-1B6SEH8 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC29.76■■■□□ 2.35
ERVV-1B6SEH8 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC29.76■■■□□ 2.35
ERVV-1B6SEH8 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
ERVV-1B6SEH8 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
ERVV-1B6SEH8 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC29.75■■■□□ 2.35
ERVV-1B6SEH8 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
ERVV-1B6SEH8 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
ERVV-1B6SEH8 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
ERVV-1B6SEH8 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
ERVV-1B6SEH8 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC29.74■■■□□ 2.35
ERVV-1B6SEH8 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
ERVV-1B6SEH8 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC29.73■■■□□ 2.35
ERVV-1B6SEH8 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
ERVV-1B6SEH8 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
ERVV-1B6SEH8 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
ERVV-1B6SEH8 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC29.72■■■□□ 2.35
ERVV-1B6SEH8 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
ERVV-1B6SEH8 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
ERVV-1B6SEH8 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC29.72■■■□□ 2.35
ERVV-1B6SEH8 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
ERVV-1B6SEH8 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
ERVV-1B6SEH8 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC29.71■■■□□ 2.35
ERVV-1B6SEH8 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC29.71■■■□□ 2.35
ERVV-1B6SEH8 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC29.71■■■□□ 2.35
ERVV-1B6SEH8 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC29.71■■■□□ 2.35
ERVV-1B6SEH8 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
ERVV-1B6SEH8 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
ERVV-1B6SEH8 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
ERVV-1B6SEH8 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
ERVV-1B6SEH8 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
ERVV-1B6SEH8 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
ERVV-1B6SEH8 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC29.7■■■□□ 2.35
ERVV-1B6SEH8 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
ERVV-1B6SEH8 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
ERVV-1B6SEH8 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
ERVV-1B6SEH8 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
ERVV-1B6SEH8 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
ERVV-1B6SEH8 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
ERVV-1B6SEH8 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
ERVV-1B6SEH8 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC29.68■■■□□ 2.34
ERVV-1B6SEH8 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
ERVV-1B6SEH8 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
ERVV-1B6SEH8 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC29.68■■■□□ 2.34
ERVV-1B6SEH8 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
ERVV-1B6SEH8 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
ERVV-1B6SEH8 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
ERVV-1B6SEH8 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
ERVV-1B6SEH8 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
ERVV-1B6SEH8 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
ERVV-1B6SEH8 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
ERVV-1B6SEH8 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
ERVV-1B6SEH8 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC29.67■■■□□ 2.34
ERVV-1B6SEH8 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
ERVV-1B6SEH8 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
ERVV-1B6SEH8 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC29.66■■■□□ 2.34
ERVV-1B6SEH8 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC29.66■■■□□ 2.34
ERVV-1B6SEH8 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
ERVV-1B6SEH8 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
ERVV-1B6SEH8 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
ERVV-1B6SEH8 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
ERVV-1B6SEH8 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
ERVV-1B6SEH8 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC29.65■■■□□ 2.34
ERVV-1B6SEH8 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
ERVV-1B6SEH8 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
ERVV-1B6SEH8 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
ERVV-1B6SEH8 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
ERVV-1B6SEH8 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
ERVV-1B6SEH8 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.34
ERVV-1B6SEH8 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
ERVV-1B6SEH8 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC29.63■■■□□ 2.33
ERVV-1B6SEH8 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC29.63■■■□□ 2.33
ERVV-1B6SEH8 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.6 ms