Protein–RNA interactions for Protein: B4E1Z4

cDNA FLJ55673, highly similar to Complement factor B (EC 3.4.21.47), humanhuman

Predictions only

Length 1,266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B4E1Z4 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
B4E1Z4 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
B4E1Z4 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
B4E1Z4 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
B4E1Z4 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
B4E1Z4 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
B4E1Z4 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
B4E1Z4 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
B4E1Z4 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
B4E1Z4 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
B4E1Z4 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
B4E1Z4 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
B4E1Z4 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
B4E1Z4 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
B4E1Z4 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
B4E1Z4 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
B4E1Z4 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
B4E1Z4 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
B4E1Z4 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC27.77■■■□□ 2.04
B4E1Z4 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
B4E1Z4 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
B4E1Z4 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.04
B4E1Z4 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
B4E1Z4 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
B4E1Z4 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
B4E1Z4 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
B4E1Z4 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC27.76■■■□□ 2.03
B4E1Z4 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
B4E1Z4 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
B4E1Z4 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC27.75■■■□□ 2.03
B4E1Z4 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
B4E1Z4 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
B4E1Z4 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
B4E1Z4 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
B4E1Z4 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
B4E1Z4 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
B4E1Z4 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
B4E1Z4 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
B4E1Z4 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
B4E1Z4 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
B4E1Z4 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
B4E1Z4 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
B4E1Z4 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
B4E1Z4 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
B4E1Z4 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
B4E1Z4 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
B4E1Z4 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
B4E1Z4 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
B4E1Z4 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
B4E1Z4 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
B4E1Z4 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
B4E1Z4 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
B4E1Z4 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
B4E1Z4 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
B4E1Z4 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
B4E1Z4 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
B4E1Z4 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
B4E1Z4 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
B4E1Z4 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
B4E1Z4 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
B4E1Z4 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
B4E1Z4 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
B4E1Z4 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
B4E1Z4 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
B4E1Z4 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
B4E1Z4 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
B4E1Z4 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
B4E1Z4 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
B4E1Z4 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
B4E1Z4 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
B4E1Z4 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
B4E1Z4 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
B4E1Z4 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
B4E1Z4 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
B4E1Z4 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
B4E1Z4 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
B4E1Z4 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
B4E1Z4 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
B4E1Z4 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
B4E1Z4 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
B4E1Z4 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
B4E1Z4 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
B4E1Z4 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
B4E1Z4 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
B4E1Z4 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
B4E1Z4 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
B4E1Z4 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
B4E1Z4 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
B4E1Z4 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
B4E1Z4 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
B4E1Z4 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
B4E1Z4 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
B4E1Z4 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
B4E1Z4 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
B4E1Z4 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
B4E1Z4 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
B4E1Z4 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.01
B4E1Z4 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.01
B4E1Z4 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
B4E1Z4 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms