Protein–RNA interactions for Protein: A7XYQ1

SOBP, Sine oculis-binding protein homolog, humanhuman

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Length 873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOBPA7XYQ1 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SOBPA7XYQ1 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SOBPA7XYQ1 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SOBPA7XYQ1 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SOBPA7XYQ1 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
SOBPA7XYQ1 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
SOBPA7XYQ1 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SOBPA7XYQ1 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SOBPA7XYQ1 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SOBPA7XYQ1 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SOBPA7XYQ1 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SOBPA7XYQ1 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
SOBPA7XYQ1 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SOBPA7XYQ1 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SOBPA7XYQ1 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SOBPA7XYQ1 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SOBPA7XYQ1 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SOBPA7XYQ1 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SOBPA7XYQ1 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SOBPA7XYQ1 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SOBPA7XYQ1 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
SOBPA7XYQ1 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SOBPA7XYQ1 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SOBPA7XYQ1 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SOBPA7XYQ1 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SOBPA7XYQ1 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SOBPA7XYQ1 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SOBPA7XYQ1 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
SOBPA7XYQ1 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SOBPA7XYQ1 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SOBPA7XYQ1 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SOBPA7XYQ1 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SOBPA7XYQ1 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SOBPA7XYQ1 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SOBPA7XYQ1 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SOBPA7XYQ1 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SOBPA7XYQ1 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SOBPA7XYQ1 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SOBPA7XYQ1 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SOBPA7XYQ1 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SOBPA7XYQ1 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SOBPA7XYQ1 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SOBPA7XYQ1 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SOBPA7XYQ1 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SOBPA7XYQ1 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SOBPA7XYQ1 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SOBPA7XYQ1 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
SOBPA7XYQ1 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SOBPA7XYQ1 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
SOBPA7XYQ1 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
SOBPA7XYQ1 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SOBPA7XYQ1 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SOBPA7XYQ1 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
SOBPA7XYQ1 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SOBPA7XYQ1 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SOBPA7XYQ1 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SOBPA7XYQ1 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SOBPA7XYQ1 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SOBPA7XYQ1 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SOBPA7XYQ1 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SOBPA7XYQ1 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SOBPA7XYQ1 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
SOBPA7XYQ1 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SOBPA7XYQ1 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SOBPA7XYQ1 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SOBPA7XYQ1 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
SOBPA7XYQ1 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SOBPA7XYQ1 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SOBPA7XYQ1 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SOBPA7XYQ1 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SOBPA7XYQ1 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SOBPA7XYQ1 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SOBPA7XYQ1 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SOBPA7XYQ1 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SOBPA7XYQ1 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SOBPA7XYQ1 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SOBPA7XYQ1 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SOBPA7XYQ1 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SOBPA7XYQ1 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SOBPA7XYQ1 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SOBPA7XYQ1 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SOBPA7XYQ1 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SOBPA7XYQ1 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SOBPA7XYQ1 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SOBPA7XYQ1 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SOBPA7XYQ1 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SOBPA7XYQ1 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SOBPA7XYQ1 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
SOBPA7XYQ1 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SOBPA7XYQ1 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SOBPA7XYQ1 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SOBPA7XYQ1 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SOBPA7XYQ1 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SOBPA7XYQ1 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SOBPA7XYQ1 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SOBPA7XYQ1 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SOBPA7XYQ1 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
SOBPA7XYQ1 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SOBPA7XYQ1 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SOBPA7XYQ1 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
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