Protein–RNA interactions for Protein: A6NNZ2

Tubulin beta-8 chain-like protein LOC260334, humanhuman

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A6NNZ2 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
A6NNZ2 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
A6NNZ2 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
A6NNZ2 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
A6NNZ2 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
A6NNZ2 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
A6NNZ2 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
A6NNZ2 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
A6NNZ2 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
A6NNZ2 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
A6NNZ2 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
A6NNZ2 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
A6NNZ2 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
A6NNZ2 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
A6NNZ2 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
A6NNZ2 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC24.52■■□□□ 1.52
A6NNZ2 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
A6NNZ2 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
A6NNZ2 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
A6NNZ2 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
A6NNZ2 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
A6NNZ2 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
A6NNZ2 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
A6NNZ2 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
A6NNZ2 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
A6NNZ2 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
A6NNZ2 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
A6NNZ2 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
A6NNZ2 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
A6NNZ2 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
A6NNZ2 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
A6NNZ2 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
A6NNZ2 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
A6NNZ2 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
A6NNZ2 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
A6NNZ2 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
A6NNZ2 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
A6NNZ2 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
A6NNZ2 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
A6NNZ2 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
A6NNZ2 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
A6NNZ2 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
A6NNZ2 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
A6NNZ2 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
A6NNZ2 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
A6NNZ2 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
A6NNZ2 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
A6NNZ2 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
A6NNZ2 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
A6NNZ2 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
A6NNZ2 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
A6NNZ2 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
A6NNZ2 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
A6NNZ2 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
A6NNZ2 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
A6NNZ2 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
A6NNZ2 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
A6NNZ2 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
A6NNZ2 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
A6NNZ2 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
A6NNZ2 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
A6NNZ2 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
A6NNZ2 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
A6NNZ2 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
A6NNZ2 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
A6NNZ2 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
A6NNZ2 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
A6NNZ2 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
A6NNZ2 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
A6NNZ2 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
A6NNZ2 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
A6NNZ2 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
A6NNZ2 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
A6NNZ2 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
A6NNZ2 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
A6NNZ2 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
A6NNZ2 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
A6NNZ2 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
A6NNZ2 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
A6NNZ2 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
A6NNZ2 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
A6NNZ2 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
A6NNZ2 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
A6NNZ2 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
A6NNZ2 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
A6NNZ2 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
A6NNZ2 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
A6NNZ2 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
A6NNZ2 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
A6NNZ2 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC24.42■■□□□ 1.5
A6NNZ2 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
A6NNZ2 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
A6NNZ2 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
A6NNZ2 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
A6NNZ2 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
A6NNZ2 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
A6NNZ2 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
A6NNZ2 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
A6NNZ2 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
A6NNZ2 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms