Protein–RNA interactions for Protein: A6NKP2

SDR42E2, Putative short-chain dehydrogenase/reductase family 42E member 2, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDR42E2A6NKP2 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
SDR42E2A6NKP2 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SDR42E2A6NKP2 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SDR42E2A6NKP2 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SDR42E2A6NKP2 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SDR42E2A6NKP2 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SDR42E2A6NKP2 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
SDR42E2A6NKP2 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SDR42E2A6NKP2 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SDR42E2A6NKP2 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
SDR42E2A6NKP2 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SDR42E2A6NKP2 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SDR42E2A6NKP2 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SDR42E2A6NKP2 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SDR42E2A6NKP2 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SDR42E2A6NKP2 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
SDR42E2A6NKP2 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SDR42E2A6NKP2 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SDR42E2A6NKP2 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SDR42E2A6NKP2 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SDR42E2A6NKP2 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SDR42E2A6NKP2 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SDR42E2A6NKP2 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SDR42E2A6NKP2 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SDR42E2A6NKP2 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SDR42E2A6NKP2 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SDR42E2A6NKP2 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SDR42E2A6NKP2 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SDR42E2A6NKP2 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SDR42E2A6NKP2 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SDR42E2A6NKP2 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SDR42E2A6NKP2 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SDR42E2A6NKP2 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SDR42E2A6NKP2 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SDR42E2A6NKP2 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SDR42E2A6NKP2 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SDR42E2A6NKP2 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SDR42E2A6NKP2 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SDR42E2A6NKP2 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SDR42E2A6NKP2 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SDR42E2A6NKP2 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SDR42E2A6NKP2 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
SDR42E2A6NKP2 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SDR42E2A6NKP2 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SDR42E2A6NKP2 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SDR42E2A6NKP2 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SDR42E2A6NKP2 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SDR42E2A6NKP2 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SDR42E2A6NKP2 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SDR42E2A6NKP2 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SDR42E2A6NKP2 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SDR42E2A6NKP2 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SDR42E2A6NKP2 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SDR42E2A6NKP2 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SDR42E2A6NKP2 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SDR42E2A6NKP2 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SDR42E2A6NKP2 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SDR42E2A6NKP2 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SDR42E2A6NKP2 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SDR42E2A6NKP2 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SDR42E2A6NKP2 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SDR42E2A6NKP2 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SDR42E2A6NKP2 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SDR42E2A6NKP2 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SDR42E2A6NKP2 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SDR42E2A6NKP2 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SDR42E2A6NKP2 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SDR42E2A6NKP2 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SDR42E2A6NKP2 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SDR42E2A6NKP2 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SDR42E2A6NKP2 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SDR42E2A6NKP2 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SDR42E2A6NKP2 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SDR42E2A6NKP2 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SDR42E2A6NKP2 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SDR42E2A6NKP2 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SDR42E2A6NKP2 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SDR42E2A6NKP2 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SDR42E2A6NKP2 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SDR42E2A6NKP2 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SDR42E2A6NKP2 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SDR42E2A6NKP2 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SDR42E2A6NKP2 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SDR42E2A6NKP2 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SDR42E2A6NKP2 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SDR42E2A6NKP2 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SDR42E2A6NKP2 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SDR42E2A6NKP2 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
SDR42E2A6NKP2 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
SDR42E2A6NKP2 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
SDR42E2A6NKP2 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SDR42E2A6NKP2 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SDR42E2A6NKP2 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SDR42E2A6NKP2 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SDR42E2A6NKP2 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SDR42E2A6NKP2 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SDR42E2A6NKP2 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SDR42E2A6NKP2 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SDR42E2A6NKP2 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SDR42E2A6NKP2 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms