Protein–RNA interactions for Protein: A6NKB5

PCNX2, Pecanex-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 2,137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCNX2A6NKB5 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
PCNX2A6NKB5 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
PCNX2A6NKB5 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
PCNX2A6NKB5 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PCNX2A6NKB5 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PCNX2A6NKB5 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PCNX2A6NKB5 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PCNX2A6NKB5 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PCNX2A6NKB5 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PCNX2A6NKB5 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PCNX2A6NKB5 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PCNX2A6NKB5 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
PCNX2A6NKB5 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
PCNX2A6NKB5 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PCNX2A6NKB5 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PCNX2A6NKB5 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
PCNX2A6NKB5 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PCNX2A6NKB5 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PCNX2A6NKB5 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PCNX2A6NKB5 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PCNX2A6NKB5 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PCNX2A6NKB5 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PCNX2A6NKB5 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PCNX2A6NKB5 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PCNX2A6NKB5 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PCNX2A6NKB5 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PCNX2A6NKB5 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PCNX2A6NKB5 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PCNX2A6NKB5 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
PCNX2A6NKB5 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PCNX2A6NKB5 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PCNX2A6NKB5 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PCNX2A6NKB5 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PCNX2A6NKB5 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
PCNX2A6NKB5 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
PCNX2A6NKB5 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PCNX2A6NKB5 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PCNX2A6NKB5 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PCNX2A6NKB5 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PCNX2A6NKB5 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PCNX2A6NKB5 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PCNX2A6NKB5 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PCNX2A6NKB5 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PCNX2A6NKB5 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PCNX2A6NKB5 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
PCNX2A6NKB5 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PCNX2A6NKB5 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PCNX2A6NKB5 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PCNX2A6NKB5 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PCNX2A6NKB5 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PCNX2A6NKB5 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PCNX2A6NKB5 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PCNX2A6NKB5 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PCNX2A6NKB5 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PCNX2A6NKB5 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PCNX2A6NKB5 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PCNX2A6NKB5 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PCNX2A6NKB5 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PCNX2A6NKB5 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PCNX2A6NKB5 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PCNX2A6NKB5 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PCNX2A6NKB5 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PCNX2A6NKB5 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PCNX2A6NKB5 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PCNX2A6NKB5 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PCNX2A6NKB5 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
PCNX2A6NKB5 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.23
PCNX2A6NKB5 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
PCNX2A6NKB5 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PCNX2A6NKB5 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PCNX2A6NKB5 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PCNX2A6NKB5 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PCNX2A6NKB5 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PCNX2A6NKB5 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PCNX2A6NKB5 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PCNX2A6NKB5 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PCNX2A6NKB5 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PCNX2A6NKB5 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PCNX2A6NKB5 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
PCNX2A6NKB5 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PCNX2A6NKB5 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PCNX2A6NKB5 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PCNX2A6NKB5 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
PCNX2A6NKB5 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PCNX2A6NKB5 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PCNX2A6NKB5 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PCNX2A6NKB5 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PCNX2A6NKB5 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PCNX2A6NKB5 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PCNX2A6NKB5 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
PCNX2A6NKB5 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PCNX2A6NKB5 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PCNX2A6NKB5 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PCNX2A6NKB5 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PCNX2A6NKB5 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PCNX2A6NKB5 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
PCNX2A6NKB5 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PCNX2A6NKB5 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PCNX2A6NKB5 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PCNX2A6NKB5 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.2 ms