Protein–RNA interactions for Protein: A6NFQ2

TCAF2, TRPM8 channel-associated factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCAF2A6NFQ2 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TCAF2A6NFQ2 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TCAF2A6NFQ2 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TCAF2A6NFQ2 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TCAF2A6NFQ2 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TCAF2A6NFQ2 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TCAF2A6NFQ2 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TCAF2A6NFQ2 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TCAF2A6NFQ2 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TCAF2A6NFQ2 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TCAF2A6NFQ2 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TCAF2A6NFQ2 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
TCAF2A6NFQ2 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TCAF2A6NFQ2 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TCAF2A6NFQ2 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TCAF2A6NFQ2 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TCAF2A6NFQ2 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TCAF2A6NFQ2 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TCAF2A6NFQ2 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TCAF2A6NFQ2 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TCAF2A6NFQ2 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TCAF2A6NFQ2 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TCAF2A6NFQ2 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TCAF2A6NFQ2 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TCAF2A6NFQ2 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TCAF2A6NFQ2 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TCAF2A6NFQ2 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TCAF2A6NFQ2 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TCAF2A6NFQ2 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TCAF2A6NFQ2 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TCAF2A6NFQ2 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TCAF2A6NFQ2 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TCAF2A6NFQ2 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TCAF2A6NFQ2 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC24.14■■□□□ 1.46
TCAF2A6NFQ2 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TCAF2A6NFQ2 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TCAF2A6NFQ2 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
TCAF2A6NFQ2 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TCAF2A6NFQ2 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TCAF2A6NFQ2 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TCAF2A6NFQ2 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TCAF2A6NFQ2 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TCAF2A6NFQ2 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TCAF2A6NFQ2 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TCAF2A6NFQ2 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TCAF2A6NFQ2 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TCAF2A6NFQ2 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TCAF2A6NFQ2 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TCAF2A6NFQ2 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
TCAF2A6NFQ2 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TCAF2A6NFQ2 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TCAF2A6NFQ2 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TCAF2A6NFQ2 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TCAF2A6NFQ2 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TCAF2A6NFQ2 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
TCAF2A6NFQ2 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TCAF2A6NFQ2 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TCAF2A6NFQ2 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TCAF2A6NFQ2 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TCAF2A6NFQ2 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
TCAF2A6NFQ2 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TCAF2A6NFQ2 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TCAF2A6NFQ2 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TCAF2A6NFQ2 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TCAF2A6NFQ2 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TCAF2A6NFQ2 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TCAF2A6NFQ2 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TCAF2A6NFQ2 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TCAF2A6NFQ2 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TCAF2A6NFQ2 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TCAF2A6NFQ2 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
TCAF2A6NFQ2 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TCAF2A6NFQ2 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TCAF2A6NFQ2 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TCAF2A6NFQ2 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
TCAF2A6NFQ2 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TCAF2A6NFQ2 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TCAF2A6NFQ2 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TCAF2A6NFQ2 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TCAF2A6NFQ2 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TCAF2A6NFQ2 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TCAF2A6NFQ2 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TCAF2A6NFQ2 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TCAF2A6NFQ2 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
TCAF2A6NFQ2 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TCAF2A6NFQ2 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TCAF2A6NFQ2 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TCAF2A6NFQ2 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TCAF2A6NFQ2 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TCAF2A6NFQ2 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TCAF2A6NFQ2 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TCAF2A6NFQ2 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TCAF2A6NFQ2 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TCAF2A6NFQ2 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TCAF2A6NFQ2 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TCAF2A6NFQ2 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
TCAF2A6NFQ2 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TCAF2A6NFQ2 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TCAF2A6NFQ2 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TCAF2A6NFQ2 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 105.6 ms