Protein–RNA interactions for Protein: A4D1U4

LCHN, Protein LCHN, humanhuman

Predictions only

Length 455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LCHNA4D1U4 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
LCHNA4D1U4 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
LCHNA4D1U4 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
LCHNA4D1U4 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
LCHNA4D1U4 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
LCHNA4D1U4 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
LCHNA4D1U4 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
LCHNA4D1U4 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
LCHNA4D1U4 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
LCHNA4D1U4 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
LCHNA4D1U4 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
LCHNA4D1U4 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC25.46■■□□□ 1.67
LCHNA4D1U4 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
LCHNA4D1U4 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
LCHNA4D1U4 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
LCHNA4D1U4 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
LCHNA4D1U4 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
LCHNA4D1U4 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
LCHNA4D1U4 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
LCHNA4D1U4 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
LCHNA4D1U4 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
LCHNA4D1U4 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
LCHNA4D1U4 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
LCHNA4D1U4 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
LCHNA4D1U4 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
LCHNA4D1U4 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
LCHNA4D1U4 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
LCHNA4D1U4 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
LCHNA4D1U4 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
LCHNA4D1U4 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
LCHNA4D1U4 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
LCHNA4D1U4 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
LCHNA4D1U4 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
LCHNA4D1U4 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
LCHNA4D1U4 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
LCHNA4D1U4 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
LCHNA4D1U4 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
LCHNA4D1U4 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
LCHNA4D1U4 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
LCHNA4D1U4 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
LCHNA4D1U4 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
LCHNA4D1U4 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
LCHNA4D1U4 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
LCHNA4D1U4 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
LCHNA4D1U4 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
LCHNA4D1U4 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
LCHNA4D1U4 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
LCHNA4D1U4 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
LCHNA4D1U4 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
LCHNA4D1U4 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
LCHNA4D1U4 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
LCHNA4D1U4 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
LCHNA4D1U4 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
LCHNA4D1U4 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
LCHNA4D1U4 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
LCHNA4D1U4 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
LCHNA4D1U4 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
LCHNA4D1U4 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
LCHNA4D1U4 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
LCHNA4D1U4 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
LCHNA4D1U4 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.37■■□□□ 1.65
LCHNA4D1U4 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
LCHNA4D1U4 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
LCHNA4D1U4 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
LCHNA4D1U4 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
LCHNA4D1U4 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
LCHNA4D1U4 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
LCHNA4D1U4 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
LCHNA4D1U4 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
LCHNA4D1U4 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
LCHNA4D1U4 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
LCHNA4D1U4 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
LCHNA4D1U4 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
LCHNA4D1U4 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
LCHNA4D1U4 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
LCHNA4D1U4 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
LCHNA4D1U4 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
LCHNA4D1U4 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
LCHNA4D1U4 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
LCHNA4D1U4 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
LCHNA4D1U4 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
LCHNA4D1U4 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
LCHNA4D1U4 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
LCHNA4D1U4 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
LCHNA4D1U4 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
LCHNA4D1U4 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
LCHNA4D1U4 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
LCHNA4D1U4 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
LCHNA4D1U4 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
LCHNA4D1U4 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
LCHNA4D1U4 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
LCHNA4D1U4 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.64
LCHNA4D1U4 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
LCHNA4D1U4 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
LCHNA4D1U4 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
LCHNA4D1U4 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
LCHNA4D1U4 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
LCHNA4D1U4 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
LCHNA4D1U4 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
LCHNA4D1U4 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms