Protein–RNA interactions for Protein: A0A0U1RQF3

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A0U1RQF3 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
A0A0U1RQF3 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
A0A0U1RQF3 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
A0A0U1RQF3 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
A0A0U1RQF3 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
A0A0U1RQF3 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
A0A0U1RQF3 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
A0A0U1RQF3 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
A0A0U1RQF3 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
A0A0U1RQF3 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
A0A0U1RQF3 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
A0A0U1RQF3 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
A0A0U1RQF3 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
A0A0U1RQF3 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
A0A0U1RQF3 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
A0A0U1RQF3 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
A0A0U1RQF3 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
A0A0U1RQF3 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
A0A0U1RQF3 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
A0A0U1RQF3 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
A0A0U1RQF3 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC25.52■■□□□ 1.68
A0A0U1RQF3 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
A0A0U1RQF3 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
A0A0U1RQF3 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
A0A0U1RQF3 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
A0A0U1RQF3 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
A0A0U1RQF3 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
A0A0U1RQF3 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
A0A0U1RQF3 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
A0A0U1RQF3 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
A0A0U1RQF3 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
A0A0U1RQF3 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
A0A0U1RQF3 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
A0A0U1RQF3 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
A0A0U1RQF3 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
A0A0U1RQF3 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
A0A0U1RQF3 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
A0A0U1RQF3 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
A0A0U1RQF3 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
A0A0U1RQF3 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
A0A0U1RQF3 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
A0A0U1RQF3 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
A0A0U1RQF3 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
A0A0U1RQF3 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
A0A0U1RQF3 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
A0A0U1RQF3 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
A0A0U1RQF3 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
A0A0U1RQF3 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
A0A0U1RQF3 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
A0A0U1RQF3 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
A0A0U1RQF3 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
A0A0U1RQF3 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
A0A0U1RQF3 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
A0A0U1RQF3 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
A0A0U1RQF3 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
A0A0U1RQF3 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
A0A0U1RQF3 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
A0A0U1RQF3 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
A0A0U1RQF3 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
A0A0U1RQF3 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC25.45■■□□□ 1.67
A0A0U1RQF3 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
A0A0U1RQF3 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
A0A0U1RQF3 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.66
A0A0U1RQF3 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC25.45■■□□□ 1.66
A0A0U1RQF3 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
A0A0U1RQF3 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
A0A0U1RQF3 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
A0A0U1RQF3 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
A0A0U1RQF3 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
A0A0U1RQF3 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
A0A0U1RQF3 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
A0A0U1RQF3 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
A0A0U1RQF3 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
A0A0U1RQF3 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
A0A0U1RQF3 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC25.44■■□□□ 1.66
A0A0U1RQF3 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
A0A0U1RQF3 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
A0A0U1RQF3 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
A0A0U1RQF3 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
A0A0U1RQF3 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
A0A0U1RQF3 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
A0A0U1RQF3 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
A0A0U1RQF3 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
A0A0U1RQF3 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
A0A0U1RQF3 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
A0A0U1RQF3 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
A0A0U1RQF3 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
A0A0U1RQF3 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
A0A0U1RQF3 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
A0A0U1RQF3 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
A0A0U1RQF3 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
A0A0U1RQF3 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
A0A0U1RQF3 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
A0A0U1RQF3 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
A0A0U1RQF3 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
A0A0U1RQF3 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
A0A0U1RQF3 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
A0A0U1RQF3 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
A0A0U1RQF3 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
A0A0U1RQF3 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.3 ms