Protein–RNA interactions for Protein: A0A087X1B8

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 175 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A087X1B8 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
A0A087X1B8 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
A0A087X1B8 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
A0A087X1B8 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
A0A087X1B8 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
A0A087X1B8 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
A0A087X1B8 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
A0A087X1B8 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
A0A087X1B8 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
A0A087X1B8 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
A0A087X1B8 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
A0A087X1B8 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
A0A087X1B8 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
A0A087X1B8 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
A0A087X1B8 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
A0A087X1B8 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
A0A087X1B8 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
A0A087X1B8 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
A0A087X1B8 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
A0A087X1B8 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
A0A087X1B8 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
A0A087X1B8 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
A0A087X1B8 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
A0A087X1B8 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
A0A087X1B8 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
A0A087X1B8 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
A0A087X1B8 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
A0A087X1B8 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
A0A087X1B8 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
A0A087X1B8 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
A0A087X1B8 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
A0A087X1B8 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
A0A087X1B8 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
A0A087X1B8 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
A0A087X1B8 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
A0A087X1B8 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
A0A087X1B8 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
A0A087X1B8 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
A0A087X1B8 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
A0A087X1B8 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
A0A087X1B8 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
A0A087X1B8 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
A0A087X1B8 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
A0A087X1B8 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
A0A087X1B8 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
A0A087X1B8 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
A0A087X1B8 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
A0A087X1B8 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
A0A087X1B8 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
A0A087X1B8 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
A0A087X1B8 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
A0A087X1B8 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
A0A087X1B8 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
A0A087X1B8 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
A0A087X1B8 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
A0A087X1B8 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
A0A087X1B8 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
A0A087X1B8 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
A0A087X1B8 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
A0A087X1B8 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
A0A087X1B8 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
A0A087X1B8 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
A0A087X1B8 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
A0A087X1B8 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
A0A087X1B8 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
A0A087X1B8 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
A0A087X1B8 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
A0A087X1B8 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
A0A087X1B8 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
A0A087X1B8 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
A0A087X1B8 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
A0A087X1B8 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
A0A087X1B8 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
A0A087X1B8 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
A0A087X1B8 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
A0A087X1B8 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
A0A087X1B8 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
A0A087X1B8 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
A0A087X1B8 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
A0A087X1B8 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
A0A087X1B8 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
A0A087X1B8 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
A0A087X1B8 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
A0A087X1B8 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
A0A087X1B8 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
A0A087X1B8 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
A0A087X1B8 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
A0A087X1B8 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
A0A087X1B8 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
A0A087X1B8 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
A0A087X1B8 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
A0A087X1B8 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
A0A087X1B8 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
A0A087X1B8 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
A0A087X1B8 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
A0A087X1B8 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
A0A087X1B8 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
A0A087X1B8 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
A0A087X1B8 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
A0A087X1B8 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.6 ms