Protein–RNA interactions for Protein: A0A087WWV3

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 80 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A087WWV3 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
A0A087WWV3 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
A0A087WWV3 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
A0A087WWV3 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
A0A087WWV3 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
A0A087WWV3 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
A0A087WWV3 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
A0A087WWV3 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
A0A087WWV3 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
A0A087WWV3 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
A0A087WWV3 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
A0A087WWV3 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
A0A087WWV3 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
A0A087WWV3 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
A0A087WWV3 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
A0A087WWV3 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
A0A087WWV3 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
A0A087WWV3 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
A0A087WWV3 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
A0A087WWV3 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
A0A087WWV3 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
A0A087WWV3 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
A0A087WWV3 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
A0A087WWV3 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
A0A087WWV3 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
A0A087WWV3 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
A0A087WWV3 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
A0A087WWV3 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
A0A087WWV3 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
A0A087WWV3 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
A0A087WWV3 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
A0A087WWV3 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
A0A087WWV3 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
A0A087WWV3 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
A0A087WWV3 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
A0A087WWV3 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
A0A087WWV3 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
A0A087WWV3 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
A0A087WWV3 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
A0A087WWV3 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
A0A087WWV3 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
A0A087WWV3 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
A0A087WWV3 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
A0A087WWV3 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
A0A087WWV3 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
A0A087WWV3 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
A0A087WWV3 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
A0A087WWV3 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
A0A087WWV3 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
A0A087WWV3 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
A0A087WWV3 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
A0A087WWV3 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
A0A087WWV3 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
A0A087WWV3 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
A0A087WWV3 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
A0A087WWV3 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
A0A087WWV3 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
A0A087WWV3 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
A0A087WWV3 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
A0A087WWV3 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
A0A087WWV3 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
A0A087WWV3 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
A0A087WWV3 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
A0A087WWV3 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
A0A087WWV3 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
A0A087WWV3 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
A0A087WWV3 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
A0A087WWV3 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
A0A087WWV3 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
A0A087WWV3 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
A0A087WWV3 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
A0A087WWV3 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
A0A087WWV3 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
A0A087WWV3 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
A0A087WWV3 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
A0A087WWV3 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
A0A087WWV3 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
A0A087WWV3 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC26.68■■□□□ 1.86
A0A087WWV3 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
A0A087WWV3 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
A0A087WWV3 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
A0A087WWV3 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
A0A087WWV3 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
A0A087WWV3 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
A0A087WWV3 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
A0A087WWV3 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
A0A087WWV3 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
A0A087WWV3 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
A0A087WWV3 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
A0A087WWV3 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
A0A087WWV3 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
A0A087WWV3 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
A0A087WWV3 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
A0A087WWV3 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
A0A087WWV3 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
A0A087WWV3 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
A0A087WWV3 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
A0A087WWV3 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC26.66■■□□□ 1.86
A0A087WWV3 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
A0A087WWV3 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 108.2 ms