Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3Y2

CHTOP, Chromatin target of PRMT1 protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHTOPQ9Y3Y2 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CHTOPQ9Y3Y2 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CHTOPQ9Y3Y2 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CHTOPQ9Y3Y2 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CHTOPQ9Y3Y2 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CHTOPQ9Y3Y2 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CHTOPQ9Y3Y2 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CHTOPQ9Y3Y2 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CHTOPQ9Y3Y2 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CHTOPQ9Y3Y2 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CHTOPQ9Y3Y2 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CHTOPQ9Y3Y2 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CHTOPQ9Y3Y2 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CHTOPQ9Y3Y2 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CHTOPQ9Y3Y2 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CHTOPQ9Y3Y2 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CHTOPQ9Y3Y2 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CHTOPQ9Y3Y2 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CHTOPQ9Y3Y2 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CHTOPQ9Y3Y2 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CHTOPQ9Y3Y2 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CHTOPQ9Y3Y2 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CHTOPQ9Y3Y2 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CHTOPQ9Y3Y2 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CHTOPQ9Y3Y2 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CHTOPQ9Y3Y2 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CHTOPQ9Y3Y2 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CHTOPQ9Y3Y2 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CHTOPQ9Y3Y2 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CHTOPQ9Y3Y2 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CHTOPQ9Y3Y2 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CHTOPQ9Y3Y2 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CHTOPQ9Y3Y2 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CHTOPQ9Y3Y2 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CHTOPQ9Y3Y2 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CHTOPQ9Y3Y2 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CHTOPQ9Y3Y2 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CHTOPQ9Y3Y2 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
CHTOPQ9Y3Y2 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CHTOPQ9Y3Y2 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CHTOPQ9Y3Y2 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CHTOPQ9Y3Y2 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CHTOPQ9Y3Y2 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CHTOPQ9Y3Y2 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CHTOPQ9Y3Y2 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CHTOPQ9Y3Y2 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CHTOPQ9Y3Y2 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CHTOPQ9Y3Y2 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CHTOPQ9Y3Y2 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CHTOPQ9Y3Y2 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CHTOPQ9Y3Y2 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CHTOPQ9Y3Y2 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CHTOPQ9Y3Y2 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CHTOPQ9Y3Y2 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CHTOPQ9Y3Y2 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CHTOPQ9Y3Y2 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CHTOPQ9Y3Y2 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CHTOPQ9Y3Y2 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CHTOPQ9Y3Y2 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CHTOPQ9Y3Y2 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.83
CHTOPQ9Y3Y2 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CHTOPQ9Y3Y2 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CHTOPQ9Y3Y2 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CHTOPQ9Y3Y2 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CHTOPQ9Y3Y2 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CHTOPQ9Y3Y2 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CHTOPQ9Y3Y2 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CHTOPQ9Y3Y2 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CHTOPQ9Y3Y2 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CHTOPQ9Y3Y2 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CHTOPQ9Y3Y2 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CHTOPQ9Y3Y2 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CHTOPQ9Y3Y2 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CHTOPQ9Y3Y2 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CHTOPQ9Y3Y2 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CHTOPQ9Y3Y2 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
CHTOPQ9Y3Y2 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CHTOPQ9Y3Y2 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CHTOPQ9Y3Y2 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CHTOPQ9Y3Y2 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CHTOPQ9Y3Y2 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CHTOPQ9Y3Y2 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CHTOPQ9Y3Y2 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CHTOPQ9Y3Y2 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CHTOPQ9Y3Y2 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CHTOPQ9Y3Y2 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CHTOPQ9Y3Y2 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CHTOPQ9Y3Y2 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CHTOPQ9Y3Y2 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CHTOPQ9Y3Y2 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CHTOPQ9Y3Y2 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CHTOPQ9Y3Y2 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CHTOPQ9Y3Y2 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CHTOPQ9Y3Y2 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CHTOPQ9Y3Y2 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CHTOPQ9Y3Y2 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CHTOPQ9Y3Y2 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CHTOPQ9Y3Y2 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CHTOPQ9Y3Y2 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CHTOPQ9Y3Y2 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms