Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y282

ERGIC3, Endoplasmic reticulum-Golgi intermediate compartment protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 383 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERGIC3Q9Y282 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
ERGIC3Q9Y282 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
ERGIC3Q9Y282 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
ERGIC3Q9Y282 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
ERGIC3Q9Y282 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
ERGIC3Q9Y282 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
ERGIC3Q9Y282 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
ERGIC3Q9Y282 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC26.18■■□□□ 1.78
ERGIC3Q9Y282 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
ERGIC3Q9Y282 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
ERGIC3Q9Y282 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
ERGIC3Q9Y282 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
ERGIC3Q9Y282 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
ERGIC3Q9Y282 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
ERGIC3Q9Y282 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
ERGIC3Q9Y282 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
ERGIC3Q9Y282 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
ERGIC3Q9Y282 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
ERGIC3Q9Y282 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
ERGIC3Q9Y282 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
ERGIC3Q9Y282 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
ERGIC3Q9Y282 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC25.99■■□□□ 1.75
ERGIC3Q9Y282 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
ERGIC3Q9Y282 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
ERGIC3Q9Y282 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
ERGIC3Q9Y282 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
ERGIC3Q9Y282 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
ERGIC3Q9Y282 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
ERGIC3Q9Y282 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
ERGIC3Q9Y282 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
ERGIC3Q9Y282 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
ERGIC3Q9Y282 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
ERGIC3Q9Y282 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
ERGIC3Q9Y282 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
ERGIC3Q9Y282 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
ERGIC3Q9Y282 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
ERGIC3Q9Y282 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
ERGIC3Q9Y282 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
ERGIC3Q9Y282 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
ERGIC3Q9Y282 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
ERGIC3Q9Y282 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC25.85■■□□□ 1.73
ERGIC3Q9Y282 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
ERGIC3Q9Y282 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
ERGIC3Q9Y282 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
ERGIC3Q9Y282 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
ERGIC3Q9Y282 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ERGIC3Q9Y282 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
ERGIC3Q9Y282 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ERGIC3Q9Y282 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
ERGIC3Q9Y282 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ERGIC3Q9Y282 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
ERGIC3Q9Y282 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
ERGIC3Q9Y282 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ERGIC3Q9Y282 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ERGIC3Q9Y282 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ERGIC3Q9Y282 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
ERGIC3Q9Y282 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ERGIC3Q9Y282 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ERGIC3Q9Y282 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ERGIC3Q9Y282 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ERGIC3Q9Y282 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ERGIC3Q9Y282 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ERGIC3Q9Y282 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
ERGIC3Q9Y282 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
ERGIC3Q9Y282 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
ERGIC3Q9Y282 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
ERGIC3Q9Y282 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
ERGIC3Q9Y282 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ERGIC3Q9Y282 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ERGIC3Q9Y282 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
ERGIC3Q9Y282 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
ERGIC3Q9Y282 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ERGIC3Q9Y282 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ERGIC3Q9Y282 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ERGIC3Q9Y282 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ERGIC3Q9Y282 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ERGIC3Q9Y282 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
ERGIC3Q9Y282 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
ERGIC3Q9Y282 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
ERGIC3Q9Y282 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ERGIC3Q9Y282 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ERGIC3Q9Y282 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ERGIC3Q9Y282 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ERGIC3Q9Y282 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
ERGIC3Q9Y282 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
ERGIC3Q9Y282 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
ERGIC3Q9Y282 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ERGIC3Q9Y282 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ERGIC3Q9Y282 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ERGIC3Q9Y282 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ERGIC3Q9Y282 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ERGIC3Q9Y282 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
ERGIC3Q9Y282 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
ERGIC3Q9Y282 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ERGIC3Q9Y282 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ERGIC3Q9Y282 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ERGIC3Q9Y282 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ERGIC3Q9Y282 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ERGIC3Q9Y282 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ERGIC3Q9Y282 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.4 ms