Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y256

RCE1, CAAX prenyl protease 2, humanhuman

Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RCE1Q9Y256 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
RCE1Q9Y256 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
RCE1Q9Y256 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
RCE1Q9Y256 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
RCE1Q9Y256 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
RCE1Q9Y256 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC25.68■■□□□ 1.7
RCE1Q9Y256 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
RCE1Q9Y256 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
RCE1Q9Y256 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
RCE1Q9Y256 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
RCE1Q9Y256 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
RCE1Q9Y256 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
RCE1Q9Y256 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
RCE1Q9Y256 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
RCE1Q9Y256 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
RCE1Q9Y256 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
RCE1Q9Y256 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
RCE1Q9Y256 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
RCE1Q9Y256 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
RCE1Q9Y256 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
RCE1Q9Y256 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
RCE1Q9Y256 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RCE1Q9Y256 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
RCE1Q9Y256 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
RCE1Q9Y256 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
RCE1Q9Y256 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
RCE1Q9Y256 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RCE1Q9Y256 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RCE1Q9Y256 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
RCE1Q9Y256 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
RCE1Q9Y256 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RCE1Q9Y256 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
RCE1Q9Y256 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RCE1Q9Y256 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RCE1Q9Y256 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RCE1Q9Y256 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RCE1Q9Y256 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RCE1Q9Y256 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RCE1Q9Y256 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RCE1Q9Y256 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RCE1Q9Y256 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
RCE1Q9Y256 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
RCE1Q9Y256 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.64
RCE1Q9Y256 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RCE1Q9Y256 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
RCE1Q9Y256 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RCE1Q9Y256 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
RCE1Q9Y256 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
RCE1Q9Y256 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
RCE1Q9Y256 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RCE1Q9Y256 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
RCE1Q9Y256 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RCE1Q9Y256 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RCE1Q9Y256 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
RCE1Q9Y256 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RCE1Q9Y256 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RCE1Q9Y256 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
RCE1Q9Y256 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
RCE1Q9Y256 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
RCE1Q9Y256 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RCE1Q9Y256 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
RCE1Q9Y256 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RCE1Q9Y256 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
RCE1Q9Y256 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RCE1Q9Y256 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RCE1Q9Y256 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
RCE1Q9Y256 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RCE1Q9Y256 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
RCE1Q9Y256 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
RCE1Q9Y256 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RCE1Q9Y256 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
RCE1Q9Y256 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
RCE1Q9Y256 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RCE1Q9Y256 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RCE1Q9Y256 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RCE1Q9Y256 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
RCE1Q9Y256 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
RCE1Q9Y256 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
RCE1Q9Y256 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
RCE1Q9Y256 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
RCE1Q9Y256 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RCE1Q9Y256 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RCE1Q9Y256 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
RCE1Q9Y256 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RCE1Q9Y256 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
RCE1Q9Y256 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
RCE1Q9Y256 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
RCE1Q9Y256 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
RCE1Q9Y256 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RCE1Q9Y256 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RCE1Q9Y256 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RCE1Q9Y256 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
RCE1Q9Y256 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
RCE1Q9Y256 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
RCE1Q9Y256 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
RCE1Q9Y256 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
RCE1Q9Y256 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
RCE1Q9Y256 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RCE1Q9Y256 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
RCE1Q9Y256 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.1 ms