Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNN4

GTF2A1L, TFIIA-alpha and beta-like factor, humanhuman

Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2A1LQ9UNN4 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
GTF2A1LQ9UNN4 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
GTF2A1LQ9UNN4 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.66
GTF2A1LQ9UNN4 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
GTF2A1LQ9UNN4 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
GTF2A1LQ9UNN4 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
GTF2A1LQ9UNN4 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
GTF2A1LQ9UNN4 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
GTF2A1LQ9UNN4 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
GTF2A1LQ9UNN4 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
GTF2A1LQ9UNN4 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
GTF2A1LQ9UNN4 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
GTF2A1LQ9UNN4 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
GTF2A1LQ9UNN4 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
GTF2A1LQ9UNN4 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
GTF2A1LQ9UNN4 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
GTF2A1LQ9UNN4 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
GTF2A1LQ9UNN4 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
GTF2A1LQ9UNN4 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
GTF2A1LQ9UNN4 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
GTF2A1LQ9UNN4 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
GTF2A1LQ9UNN4 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
GTF2A1LQ9UNN4 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
GTF2A1LQ9UNN4 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
GTF2A1LQ9UNN4 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
GTF2A1LQ9UNN4 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
GTF2A1LQ9UNN4 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
GTF2A1LQ9UNN4 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
GTF2A1LQ9UNN4 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
GTF2A1LQ9UNN4 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
GTF2A1LQ9UNN4 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
GTF2A1LQ9UNN4 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
GTF2A1LQ9UNN4 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
GTF2A1LQ9UNN4 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
GTF2A1LQ9UNN4 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
GTF2A1LQ9UNN4 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
GTF2A1LQ9UNN4 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
GTF2A1LQ9UNN4 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
GTF2A1LQ9UNN4 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
GTF2A1LQ9UNN4 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
GTF2A1LQ9UNN4 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
GTF2A1LQ9UNN4 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
GTF2A1LQ9UNN4 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
GTF2A1LQ9UNN4 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
GTF2A1LQ9UNN4 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
GTF2A1LQ9UNN4 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
GTF2A1LQ9UNN4 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
GTF2A1LQ9UNN4 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
GTF2A1LQ9UNN4 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
GTF2A1LQ9UNN4 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
GTF2A1LQ9UNN4 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
GTF2A1LQ9UNN4 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
GTF2A1LQ9UNN4 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
GTF2A1LQ9UNN4 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
GTF2A1LQ9UNN4 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
GTF2A1LQ9UNN4 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
GTF2A1LQ9UNN4 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
GTF2A1LQ9UNN4 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
GTF2A1LQ9UNN4 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
GTF2A1LQ9UNN4 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
GTF2A1LQ9UNN4 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
GTF2A1LQ9UNN4 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
GTF2A1LQ9UNN4 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
GTF2A1LQ9UNN4 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
GTF2A1LQ9UNN4 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
GTF2A1LQ9UNN4 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
GTF2A1LQ9UNN4 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
GTF2A1LQ9UNN4 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
GTF2A1LQ9UNN4 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
GTF2A1LQ9UNN4 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
GTF2A1LQ9UNN4 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
GTF2A1LQ9UNN4 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
GTF2A1LQ9UNN4 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
GTF2A1LQ9UNN4 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
GTF2A1LQ9UNN4 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
GTF2A1LQ9UNN4 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
GTF2A1LQ9UNN4 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
GTF2A1LQ9UNN4 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
GTF2A1LQ9UNN4 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
GTF2A1LQ9UNN4 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
GTF2A1LQ9UNN4 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
GTF2A1LQ9UNN4 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
GTF2A1LQ9UNN4 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
GTF2A1LQ9UNN4 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
GTF2A1LQ9UNN4 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
GTF2A1LQ9UNN4 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
GTF2A1LQ9UNN4 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
GTF2A1LQ9UNN4 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
GTF2A1LQ9UNN4 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
GTF2A1LQ9UNN4 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
GTF2A1LQ9UNN4 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
GTF2A1LQ9UNN4 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
GTF2A1LQ9UNN4 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
GTF2A1LQ9UNN4 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
GTF2A1LQ9UNN4 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
GTF2A1LQ9UNN4 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
GTF2A1LQ9UNN4 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
GTF2A1LQ9UNN4 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
GTF2A1LQ9UNN4 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
GTF2A1LQ9UNN4 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.1 ms