Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMW8

USP18, Ubl carboxyl-terminal hydrolase 18, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP18Q9UMW8 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
USP18Q9UMW8 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC30.4■■■□□ 2.46
USP18Q9UMW8 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
USP18Q9UMW8 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
USP18Q9UMW8 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.36■■■□□ 2.45
USP18Q9UMW8 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC30.36■■■□□ 2.45
USP18Q9UMW8 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.32■■■□□ 2.44
USP18Q9UMW8 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
USP18Q9UMW8 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
USP18Q9UMW8 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
USP18Q9UMW8 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC30.25■■■□□ 2.43
USP18Q9UMW8 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
USP18Q9UMW8 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
USP18Q9UMW8 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.22■■■□□ 2.43
USP18Q9UMW8 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
USP18Q9UMW8 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
USP18Q9UMW8 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC30.19■■■□□ 2.42
USP18Q9UMW8 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC30.17■■■□□ 2.42
USP18Q9UMW8 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC30.16■■■□□ 2.42
USP18Q9UMW8 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC30.13■■■□□ 2.41
USP18Q9UMW8 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC30.12■■■□□ 2.41
USP18Q9UMW8 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.1■■■□□ 2.41
USP18Q9UMW8 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
USP18Q9UMW8 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
USP18Q9UMW8 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
USP18Q9UMW8 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
USP18Q9UMW8 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC30.01■■■□□ 2.39
USP18Q9UMW8 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30■■■□□ 2.39
USP18Q9UMW8 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC30■■■□□ 2.39
USP18Q9UMW8 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
USP18Q9UMW8 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
USP18Q9UMW8 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC29.95■■■□□ 2.39
USP18Q9UMW8 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
USP18Q9UMW8 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
USP18Q9UMW8 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC29.93■■■□□ 2.38
USP18Q9UMW8 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
USP18Q9UMW8 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
USP18Q9UMW8 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
USP18Q9UMW8 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
USP18Q9UMW8 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
USP18Q9UMW8 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
USP18Q9UMW8 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
USP18Q9UMW8 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
USP18Q9UMW8 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
USP18Q9UMW8 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
USP18Q9UMW8 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
USP18Q9UMW8 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
USP18Q9UMW8 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
USP18Q9UMW8 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
USP18Q9UMW8 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC29.81■■■□□ 2.36
USP18Q9UMW8 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
USP18Q9UMW8 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
USP18Q9UMW8 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
USP18Q9UMW8 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
USP18Q9UMW8 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
USP18Q9UMW8 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.35
USP18Q9UMW8 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
USP18Q9UMW8 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
USP18Q9UMW8 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
USP18Q9UMW8 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
USP18Q9UMW8 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
USP18Q9UMW8 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
USP18Q9UMW8 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
USP18Q9UMW8 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
USP18Q9UMW8 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
USP18Q9UMW8 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
USP18Q9UMW8 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
USP18Q9UMW8 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC29.68■■■□□ 2.34
USP18Q9UMW8 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
USP18Q9UMW8 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
USP18Q9UMW8 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
USP18Q9UMW8 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
USP18Q9UMW8 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
USP18Q9UMW8 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
USP18Q9UMW8 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
USP18Q9UMW8 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
USP18Q9UMW8 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
USP18Q9UMW8 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
USP18Q9UMW8 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC29.58■■■□□ 2.33
USP18Q9UMW8 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
USP18Q9UMW8 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
USP18Q9UMW8 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
USP18Q9UMW8 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
USP18Q9UMW8 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
USP18Q9UMW8 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC29.54■■■□□ 2.32
USP18Q9UMW8 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC29.53■■■□□ 2.32
USP18Q9UMW8 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
USP18Q9UMW8 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC29.52■■■□□ 2.32
USP18Q9UMW8 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC29.51■■■□□ 2.31
USP18Q9UMW8 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
USP18Q9UMW8 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
USP18Q9UMW8 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
USP18Q9UMW8 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
USP18Q9UMW8 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
USP18Q9UMW8 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
USP18Q9UMW8 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
USP18Q9UMW8 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
USP18Q9UMW8 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
USP18Q9UMW8 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
USP18Q9UMW8 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.38■■■□□ 2.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.7 ms