Protein–RNA interactions for Protein: Q9UM00

TMCO1, Calcium load-activated calcium channel, humanhuman

Predictions only

Length 188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMCO1Q9UM00 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
TMCO1Q9UM00 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
TMCO1Q9UM00 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
TMCO1Q9UM00 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
TMCO1Q9UM00 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
TMCO1Q9UM00 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
TMCO1Q9UM00 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
TMCO1Q9UM00 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
TMCO1Q9UM00 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
TMCO1Q9UM00 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
TMCO1Q9UM00 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
TMCO1Q9UM00 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
TMCO1Q9UM00 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
TMCO1Q9UM00 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
TMCO1Q9UM00 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
TMCO1Q9UM00 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
TMCO1Q9UM00 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
TMCO1Q9UM00 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
TMCO1Q9UM00 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
TMCO1Q9UM00 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
TMCO1Q9UM00 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
TMCO1Q9UM00 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
TMCO1Q9UM00 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
TMCO1Q9UM00 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
TMCO1Q9UM00 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC27.97■■■□□ 2.07
TMCO1Q9UM00 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.07
TMCO1Q9UM00 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
TMCO1Q9UM00 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
TMCO1Q9UM00 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
TMCO1Q9UM00 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
TMCO1Q9UM00 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
TMCO1Q9UM00 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
TMCO1Q9UM00 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
TMCO1Q9UM00 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
TMCO1Q9UM00 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
TMCO1Q9UM00 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
TMCO1Q9UM00 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
TMCO1Q9UM00 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
TMCO1Q9UM00 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
TMCO1Q9UM00 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
TMCO1Q9UM00 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
TMCO1Q9UM00 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
TMCO1Q9UM00 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
TMCO1Q9UM00 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
TMCO1Q9UM00 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
TMCO1Q9UM00 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
TMCO1Q9UM00 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
TMCO1Q9UM00 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
TMCO1Q9UM00 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
TMCO1Q9UM00 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC27.7■■■□□ 2.02
TMCO1Q9UM00 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
TMCO1Q9UM00 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
TMCO1Q9UM00 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
TMCO1Q9UM00 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
TMCO1Q9UM00 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
TMCO1Q9UM00 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
TMCO1Q9UM00 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
TMCO1Q9UM00 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.01
TMCO1Q9UM00 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
TMCO1Q9UM00 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
TMCO1Q9UM00 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
TMCO1Q9UM00 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
TMCO1Q9UM00 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
TMCO1Q9UM00 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
TMCO1Q9UM00 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
TMCO1Q9UM00 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
TMCO1Q9UM00 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
TMCO1Q9UM00 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
TMCO1Q9UM00 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
TMCO1Q9UM00 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
TMCO1Q9UM00 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
TMCO1Q9UM00 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
TMCO1Q9UM00 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
TMCO1Q9UM00 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
TMCO1Q9UM00 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
TMCO1Q9UM00 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
TMCO1Q9UM00 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
TMCO1Q9UM00 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
TMCO1Q9UM00 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
TMCO1Q9UM00 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
TMCO1Q9UM00 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
TMCO1Q9UM00 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
TMCO1Q9UM00 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
TMCO1Q9UM00 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
TMCO1Q9UM00 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
TMCO1Q9UM00 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
TMCO1Q9UM00 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
TMCO1Q9UM00 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
TMCO1Q9UM00 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
TMCO1Q9UM00 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
TMCO1Q9UM00 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
TMCO1Q9UM00 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
TMCO1Q9UM00 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
TMCO1Q9UM00 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC27.34■■□□□ 1.97
TMCO1Q9UM00 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
TMCO1Q9UM00 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
TMCO1Q9UM00 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
TMCO1Q9UM00 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
TMCO1Q9UM00 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
TMCO1Q9UM00 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.5 ms